СПЕКТР canSNP-ГЕНОТИПОВ КАК ПОКАЗАТЕЛЬ ВНУТРИВИДОВОГО ГЕНЕТИЧЕСКОГО И ФЕНОТИПИЧЕСКОГО РАЗНООБРАЗИЯ ШТАММОВ BACILLUS ANTHRACIS, ВЫДЕЛЕННЫХ НА СЕВЕРНОМ КАВКАЗЕ И СОПРЕДЕЛЬНЫХ ТЕРРИТОРИЯХ

Аннотация:

Для оценки генетического разнообразия проведен ретроспективный анализ канонических SNP 52 штаммов возбудителя сибирской язвы, выделенных на Северном Кавказе и сопредельных с ним территориях на протяжении 68 лет из различного материала во время вспышек сибирской язвы. Выявлена значительная вариабельность SNP-локусов. Показаны наиболее распространенные и редко встречающиеся SNP-генотипы, их количественное и временное распространение в республиках Северного Кавказа и на сопредельных территориях. Рассматривается связь принадлежности штаммов к редкому SNP-генотипу В.Вг001/002 с особенностями фенотипических свойств этих культур, а также роль смешанных по фено- и генотипу популяций штаммов Bacillus anthracis в сохранении потенциала патогенности в различных условиях и достоверности их генетического маркирования при эпидемиологическом расследовании вспышек сибирской язвы. Проблема сибирской язвы остается актуальной для многих стран мира, в том числе для Российской Федерации. Только на территории Северного Кавказа зарегистрировано 1880 стационарно неблагополучных по сибирской язве пунктов. Периодическое проявление эпидемической активности стационарно неблагополучных пунктов и возникновение заболеваний людей или животных вследствие заноса инфекции из других территорий требуют разных подходов в проведении противоэпидемических мероприятий. Существенную помощь в решении этих вопросов может оказать применение методов молекулярно-генетического типирования выделенных во время вспышки штаммов возбудителя сибирской язвы. Для определения степени генетического родства штаммов В. anthracis используют два метода с разной дискриминирующей способностью: многолокусный анализ вариабельных тандемных повторов (MLVA) и анализ канонических единичных нуклеотидных полиморфизмов (canSNP). Использование канонических SNP позволяет определять принадлежность конкретных штаммов к основным генетическим линиям сибиреязвенного микроба, каждая из которых имеет некоторую приуроченность к определенному географическому региону. Цель исследования - определение canSNP-генотипов и выявление их связи с фенотипическими свойствами штаммов В. anthracis, выделенных на территории Северного Кавказа, а также сопредельных территориях юга России и стран ближнего зарубежья.

Авторы:

Издание: Медицинский вестник Северного Кавказа
Год издания: 2019
Объем: 4с.
Дополнительная информация: 2019.-N 4.-С.580-583. Библ. 8 назв.
Просмотров: 18