МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКОЕ ТИПИРОВАНИЕ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ ОСТРЫХ КИШЕЧНЫХ ИНФЕКЦИЙ БАКТЕРИАЛЬНОЙ И ВИРУСНОЙ ЭТИОЛОГИИ, ВЫЯВЛЕННЫХ НА ТЕРРИТОРИИ СТАВРОПОЛЬСКОГО КРАЯ В 2016 ГОДУ

Аннотация:

Приведены результаты субвидового генетического типирования штаммов и изолятов нуклеиновых кислот возбудителей ОКИ бактериальной и вирусной этиологии, выявленных на территории Ставропольского края в 2016 году. Выполнен MLVA-анализ 36 штаммов S. enteritidis, генетическое типирование 16 изолятов РНК ротавирусов. 3 энтеровирусов, 2 норовирусов. Исследуемые штаммы S. enteritidis отличались высокой генетической гетерогенностью и относились к 11 MVLA-генотипам. Выявлены ротавирусы, принадлежащие генотипам: G4[P8] (68,7%), G2[P4] (18,8%), G9[P8] (12,5%), норовирусы GII.Pe-GII.4-Sydney-2012 и GII.P16-GII.4-Sydney-2012, энтеровирусы Echovirus 5 и Echovirus 3. На основании результатов генетической идентификации изолятов возбудителей ОКИ проведена оценка их эпидемиологической значимости и определены особенности региональных штаммов возбудителей ОКИ. Полученные данные могут быть использованы при эпидемиологическом анализе спорадических случаев и эпидемических вспышек ОКИ в Ставропольском крае. Качественное проведение эпидемиологического мониторинга возбудителей инфекционных болезней, прогнозирование возможных осложнений эпидемиологической обстановки невозможны без эффективной системы идентификации штаммов. В последние годы широкое практическое применение для субвидовой характеристики микроорганизмов получили методы молекулярно-генетического анализа, обладающие большей дифференцирующей способностью по сравнению с фенотипическими методами типирования. Использование методов генетической идентификации возбудителей для эпидемиологического анализа ограничено рядом условий, в том числе отсутствием в открытом доступе баз данных, содержащих наряду со сведениями о мировом генетическом разнообразии возбудителей информацию о генетических особенностях штаммов, циркулирующих в данный момент в отдельных регионах. Создание баз данных генотипов региональных штаммов и осуществление генетического мониторинга популяций возбудителей актуально, в первую очередь, для патогенов, способных вызывать тяжелые формы заболеваний (возбудители особо опасных и природно-очаговых инфекций) и массовые вспышки инфекционных болезней (возбудители острых кишечных и респираторных инфекций). Цель работы - проведение субвидового генетического типирования штаммов и изолятов нуклеиновых кислот (НК) возбудителей ОКИ бактериальной и вирусной этиологии, накопление данных о генетических особенностях региональных штаммов вобудителей ОКИ, выявленных на территории Ставропольского края в 2016 г.

Авторы:

Издание: Медицинский вестник Северного Кавказа
Год издания: 2019
Объем: 4с.
Дополнительная информация: 2019.-N 4.-С.587-590. Библ. 10 назв.
Просмотров: 26