Виртуальный скрининг с использованием изменения структурного остова лигандов для поиска новых ингибиторов бета-лактамаз

Аннотация:

Для поиска новых ингибиторов бета-лактамаз, обуславливающих устойчивость бактерий к бета-лактамным антибиотикам, осуществлен виртуальный скрининг, в основу которого положено изменение структурного остова лигандов. В качестве стартовых молекул были заданы структуры известных ингибиторов бета-лактамаз и был выполнен поиск их структурных аналогов, имеющих похожую форму. Для этого использовали набор дескрипторов, включающий описание общих характеристик молекулы, её хиральности, моментов одномерного распределения расстояний между атомами молекулы и моментов более высокого порядка, которые применяются в методах распознавания образов, но не использовались ранее для поиска структур лигандов. Данный подход был использован для поиска аналогов четырёх описанных в литературе аллостерических ингибиторов сериновых бета-лактамаз. После виртуального скрининга in silico было экспериментально исследовано влияние двух выбранных лигандов на активность рекомбинантных бета-лактамаз ТЕМ типа. Это позволило обнаружить новые ингибиторы не бета-лактамной природы, показавшие более высокую эффективность ингибирования бета-лактамаз по сравнению со стартовыми молекулами.

Авторы:

Издание: Биомедицинская химия
Год издания: 2019
Объем: 9с.
Дополнительная информация: 2019.-N 6.-С.468-476. Библ. 56 назв.
Просмотров: 11