Диагностический потенциал кишечной микробиоты при болезни Паркинсона

Аннотация:

В настоящий момент ведется активная работа по поиску биомаркеров болезни Паркинсона (БП), в частности для проведения ранней диагностики данного заболевания. Одним из потенциальных источников биомаркеров является кишечная микробиота, изменения в составе которой при БП активно изучаются. Целью данной работы является идентификация микробиотных биомаркеров БП с оцененной точностью диагностики, в том числе и дифференциальной, относительно других неврологических заболеваний для пациентов российской популяции. В исследование было включено 192 метагеномных профиля кишечной микробиоты, полученных в результате ампликонного секвенирования бактериальной 16S рРНК от пациентов с болезнью Паркинсона (n = 93), лиц контрольной группы (n = 66) и другими неврологическими заболеваниями (n = 33). Для создания классифицирующих моделей использовали наивный байесовский классификатор, искусственную нейронную сеть, машину опорных векторов, обобщенную линейную модель и регрессию методом частичных наименьших квадратов. В результате оптимальные показатели классификации пациентов по составу кишечной микробиоты на валидационной выборке (чувствительность 91,30%, специфичность 91,67% при точности в 91,49%) продемонстрировал наивный байесовский алгоритм при использовании представленности микроорганизмов родов Christ ens enell a, Methanobrevibacter, Leuconostoc, Enterococcus, Catabacter, Desulfovibrio, Sphingomonas, Yokenella, Atopobium, Fusicatenibacter, Cloacibacillus, Bulleidia, Acetanaerobacterium и Staphylococcus в качестве предикторов. Выводы. Информация о таксономическом составе кишечной микробиоты может быть использована для проведения дифференциальной диагностики болезни Паркинсона.

Авторы:

Издание: Бюллетень сибирской медицины
Год издания: 2019
Объем: 10с.
Дополнительная информация: 2019.-N 4.-С.92-101. Библ. 27 назв.
Просмотров: 26