АНАЛИЗ ТРАЕКТОРИИ ОБРАЗОВАНИЯ ПРОМЕЖУТОЧНОГО ГЛИКОЗИЛФЕРМЕНТА В МЕХАНИЗМЕ ДЕЙСТВИЯ НЕЙРАМИНИДАЗЫ ВИРУСА ГРИППА А МЕТОДАМИ МОЛЕКУЛЯРНОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ

Аннотация:

Комплексное использование методов классической молекулярной динамики, симуляции титрования ионизируемых остатков, метадинамики, а также комбинированного метода квантовой механики/молекулярной механики позволило выявить альтернативный путь образования промежуточного гликозилфермента в механизме действия нейраминидазы вируса гриппа A H5N1. Ключевую роль в механизме обеспечивает остаток Asp 151, расположенный на подвижной петле и позволяющий реализовать каталитическую функцию фермента в широком интервале рН окружающей среды благодаря формированию сети взаимодействий с молекулами воды. Так как размножение гриппа у птиц проходит в условиях пищеварительной системы при низких значениях рН, а у человека — в дыхательных путях в условиях близких к нейтральным, существование альтернативных путей протекания реакции при разной кислотности среды может опосредовать двойной тропизм вируса и циркуляцию специфических штаммов вируса H5N1, склонных к передаче от птиц к человеку. Высокопатогенные штаммы вируса гриппа H5N1 («птичий грипп») представляют серьезную проблему не только для популяций диких и одомашненных птиц, но и способны вызывать вспышки заболевания среди людей (смертность -60%). Несмотря на то что по данным Всемирной организации здравоохранения пик инфекции наблюдали с 1998 по 2015 гг., до сих пор выясняют детали адаптации вируса к человеку, т.к. проявление двойного тропизма вируса (птица/человек) представляет чрезвычайно опасный путь вирусной эволюции. Заражение, как правило, происходит путем взаимодействия вируса с клеткой хозяина через гликановые рецепторы клеточной мембраны — олигосахаридные фрагменты с концевой сиаловой кислотой.

Авторы:

Издание: Биохимия
Год издания: 2020
Объем: 11с.
Дополнительная информация: 2020.-N 4.-С.567-577. Библ. 29 назв.
Просмотров: 25