Дальневосточный государственный медицинский университет Поиск | Личный кабинет | Авторизация
Поиск статьи по названию
Поиск книги по названию
Каталог рубрик
в коллекциюДобавить в коллекцию

КОМПЬЮТЕРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ КАК ИНСТРУМЕНТ ИЗУЧЕНИЯ ЛИГАНДНОГО ПОТЕНЦИАЛА ЛАКТАТА


Аннотация:

Изучение взаимодействий между белками и малыми молекулами является актуальным направлением современной фундаментальной науки. Расширение знаний в этой области во многом связано с появлением возможностей моделирования биологической активности соединений in silico. Цель исследования - определить потенциальных белковых партнеров взаимодействия для лактата с применением компьютерной среды STITCH 5.0. Методы. Для прогнозирования белковых партнеров лактата использована программа STITCH (http://stitch.embl.de/). Данная программа строит прогноз в отношении возможного взаимодействия с белками с помощью математического алгоритма, основанном на расчете константы ингибирования, используя при этом информацию, находящуюся в открытых библиотеках химических структур. Содержит 430 000 химических соединений, 9 600 000 белков, 2031 модельный организм. Выбрано графическое отображение полученных результатов в зависимости от аффинитета связи, со степенью вероятности Ра > 0,5. Результаты. Выявлено 367 потенциальных белковых партнеров лактата. Предсказана возможность интермедиата взаимодействовать с митохондриальным переносчиком пирувата, аквапоринами, влиять на передачу гормонального сигнала и нервного импульса, оказывать нейпротекторное действие. Выводы. Полученные данные свидетельствуют об обширной неметаболической роли лактата в регуляции различных биологических процессов, что определяет новые подходы к формированию экспериментальных моделей для подтверждения прогнозируемых эффектов.

Авторы:

Кузьмичева В.И.
Гильмиярова Ф.Н.
Авдеева Е.В.

Издание: Вопросы биологической, медицинской и фармацевтической химии
Год издания: 2020
Объем: 6с.
Дополнительная информация: 2020.-N 4.-С.10-15. Библ. 12 назв.
Просмотров: 20

Рубрики
Ключевые слова
em
in
st
аквапорины
активность
акты
алгоритм
аффинитет
белки
белковая
белковый
белокЕ7
библиотека
биологический
вероятности
взаимодействие
взаимоотношения
возможности
вывод
гормон
графический
данные
данных
действие
зависимости
знание
изучение
импульсов
ингибирование
инструмент
интермедиаты
информации
использованием
исследование
ключ
компьютерная
компьютерное
константа
лактат
лактаты
лиганды
малого
математическая
метод
митохондриальная
модели
моделирование
молекула
направлениях
наука
немая
нервного
новые
областей
обширные
организм
основания
открытого
отношение
партнеры
передача
переносчик
пируват
подход
пола
помощи
потенциал
потенциальный
применение
прогноз
прогнозирование
программ
процесс
различный
расчет
расширение
регуляции
результата
роли
свидетельства
связей
сигнал
слова
современная
соединение
среда
степени
структур
фармацевтическая
формирование
химические
химия
цель
экспериментальная
эффект
Ваш уровень доступа: Посетитель (IP-адрес: 3.129.69.134)
Яндекс.Метрика