Профаговые последовательности в геномах вагинальных видов лактобактерий

Аннотация:

Лактобактерии являются основным компонентом здоровой микробиоты влагалища. Снижение количества лактобактерий свидетельствует о нарушении равновесного состояния вагинального микробиоиеноза и может привести к колонизации влагалища потенциально патогенными бактериями и грибами, что сопровождается развитием инфекций и различных дисфункций органов малого таза. Серьезное влияние на состав и структуру вагинальной микробиоты могут оказывать бактериофаги. Цель работы — выявление и определение генетического разнообразия потенциально активных умеренных бактериофагов в геномах основных вагинальных видов лактобактерий на основании геномных и метагеномных данных. Материал и методы. Для оценки возможного присутствия профаговых последовательностей в геномах лактобактерий были проанализированы 129 геномных сборок лактобактерий видов L. crispatus, L. jensenii, L. iners и L. gasseri, а также 4 доступных вирусных WGS-метагенома влагалища от пациентки с бактериальным вагинозом. Результаты. В результате был получен неизбыточный список из 51 последовательности предположительных профагов. Распределение предположительных профагов по видам лактобактерий имело следующую структуру: 12 было найдено в 9 из 18 проанализированных геномов L. jensenii, 23 — в 17 из 34 проанализированных геномов L. gasseri, 9 — в 8 из 56 проанализированных геномов L. crispatus и 7 — в 7 из 21 проанализированных геномов L. iners. Некоторые из выявленных профагов имели сходство с описанными ранее профагами L. jensenii и L. gasseri, другие предсказанные профаги аналогов не имели. Вывод. Впервые получены свидетельства существования профагов у L. iners. Выявленные профаговые последовательности были специфичны для каждого вида, т.е. не встречались у других видов лактобактерий. Полученные данные могут быть использованы при исследовании роли профагов в этиологии бактериального вагиноза.

Авторы:

Издание: Молекулярная генетика ,микробиология и вирусология
Год издания: 2020
Объем: 8с.
Дополнительная информация: 2020.-N 2.-С.82-89. Библ. 22 назв.
Просмотров: 15