Анализ ассоциации полиморфизма генов CLIC1, MSH5, C6orf26, C6orf25 с уровнем экспрессии гена HSPA1B

Аннотация:

Белки теплового шока (HSPs, heatshock proteins) образуют одну из клеточных молекулярных систем, обладающую шаперонной активностью, направленную на стабилизацию структуры внутриклеточных протеинов, обеспечение устойчивости клеток к стрессу, на ренатурацию неправильно свернутых и элиминацию денатурированных цитоплазматических белков. Учитывая важную роль нарушений уровня экспрессии HSPs в патогенезе целого ряда заболеваний, в нашей работе был проведен поиск ассоциации наличия однонуклеотидных замен (SNPs) в отобранных нами актуальных участках генома с базальным уровнем транскрипционной активности генов группы HSPA, а именно HSPA1A/B, HSPA1A, HSPA1B, HSPA6w HSPA8 в мононуклеарных лейкоцитах (РВМС) в группе добровольцев из популяции населения средней части России. Исследование проводили с использованием ДНК и РНК, выделенных из лимфоцитов периферической крови 16 доноров. Генотипирование проводилось методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) с последующим секвенированием ПЦР продукта. Для оценки уровня экспрессии генов группы HSPA проводили синтез кДНК на матрице РНК, выделенной из образцов клеточных фракций РВМС с последующим проведением полимеразной цепной реакции в режиме реального времени. Было проведено генотипирование участков, в которых находятся следующие полиморфизмы: rs400547 (A/G), rs 1150793 (G/A), rs707936 (A/G), rs707915 (A/T), rs376510 (Т/С), находящиеся в генах СLIC1, MSH5, C6orf26, MSH5, C6orf25 соответственно. Был охарактеризован базальный уровень транскрипции генов конститутивно экспрессирующихся и индуцируемых белков семейства HSP70 и проведен поиск ассоциации их экспрессии с полиморфизмами. Было обнаружено, что в клетках РВМС генотип AG/AA (SNP rs400547), AG/GG (rsl 150793), AG (rs707936), ТА (rs707915), ТС (rs376510) по изученным нами участкам ассоциирован с понижением транскрипции гена HSPA1B (р=0,02), по сравнению с гомозиготами: GG (SNP rs400547), АА (rsl 150793), GG (rs707936), ТТ (rs707915), СС (rs376510). Ассоциации указанных полиморфизмов с экспрессией генов HSPA1A, HSPA6 и HSPA8 выявлено не было. Гены CLIC1, MSH5, C6orf26, C6orf25, в которых присутствуют изученные нами полиморфизмы, находятся в одном локусе вблизи гена HSPA 1В на 6-й хромосоме. Обнаруженное нами снижение экспрессии гена HSPA 1В при наличии однонуклеотидных полиморфизмов в близлежащих генах может свидетельствовать о пространственных взаимодействиях этого локуса и локуса гена HSPA1B и о том, что изменение генотипа CLIC1, MSH5, C6orf26, C6orf25 может повлечь за собой изменение экспрессии близко расположенных генов, которые являются функционально значимыми для клетки.

Авторы:

Издание: Медицинская иммунология
Год издания: 2020
Объем: 6с.
Дополнительная информация: 2020.-N 4.-С.779-784. Библ. 12 назв.
Просмотров: 16