Технические аспекты «жидкостной биопсии»: влияние физиологических и преаналитических параметров на уровень циркулирующей опухолевой ДНК

Аннотация:

«Жидкостная биопсия» — одно из наиболее популярных направлений молекулярной онкологии. Суть данной процедуры сводится к детекции и мониторингу опухоль-специфических маркеров в различных жидкостях организма (крови, моче, плевральной жидкости и т.д.). Значительные усилия направлены на то, чтобы перевести в неинвазивный формат наиболее востребованные мутационные тесты, в частности, анализ генов EGFR, KRAS, BRAF и т.д. Тем не менее, несмотря на чрезвычайную привлекательность, «жидкостная биопсия» пока не может рутинно применяться в диагностической деятельности, т.к. не обладает достаточной чувствительностью и специфичностью. Данное исследование направленно на улучшение операционных характеристик этого метода в отношении карцином толстой кишки (РТК), легкого (РЛ) и меланом, содержащих клинически значимые мутации (KRAS: нуклеотидные замены в кодонах 12, 13, 61, 146; EGFR: exl9del и L858R; BRAF: V600E). С помощью цифровой-капельной YAYVV (d&PCR) 411 образцов плазмы от 88 пациентов было протестировано на предмет наличия соответствующих опухолевых мутаций в циркулирующей опухолевой ДНК (цоДНК). Присутствие в плазме «му-тантных» копий генов было зафиксировано в 32/57 (56%) РТК, 7/14 (50%) РЛ и в 4/17 (24%) случаях меланомы. Среди пациентов с отдаленными метастазами доля «плазма-позитивных» случаев была выше, чем в группе с локализованным процессом [34/56 (61%) vs. 5/15 (33%), р = 0.058]. У 86 пациентов имелись серийные образцы плазмы, полученные, как минимум, в двух разных временных точках (9.00 и 16.00), до и после физической нагрузки, натощак и после приема пищи. Количественный анализ цоДНК в серийных образцах позволил сделать заключение о том, что циркадианные ритмы и указанные физиологические параметры не оказывают заметного влияния на концентрацию цоДНК в крови онкологических пациентов. Выполненные эксперименты, тем не менее, продемонстрировали наличие существенной вариабельности уровня цоДНК в плазме больных, в том числе у одного и того же пациента, в течение относительно коротких промежутков времени. Это обстоятельство диктует необходимость выполнять серийный забор материала и повторных испытаний для случаев, когда успех «жидкостной биопсии» имеет решающее значение для последующего принятия клинически важных решений.

Авторы:

Издание: Вопросы онкологии
Год издания: 2020
Объем: 7с.
Дополнительная информация: 2020.-N 4.-С.391-397. Библ. 35 назв.
Просмотров: 19