Полногеномное секвенированне и филогенетический анализ штамма вируса бешенства «Moscow 3253», адаптированного к перевиваемой линии клеток Vего

Аннотация:

Цель исследования. Молекулярно-генетический анализ генома производственного штамма вируса бешенства «Moscow 3253», адаптированного к клеточной линии Vera. Материал и методы. Выделенную кАНК специфически обогащали нуклеотидной последовательностью всего генома исследуемого вируса с помощью амплификации. Полногеномное секвенирование проводили на платформе «Ion PGM» и дополнительно с использованием генетического анализатора АВ 3500x1. Выравнивание и сборку секвенированных последовательностей в полный геном и дальнейший анализ осуществляли с помощью программы DNASTAR Lasergene 11.2 и MEGA 7. Филогенетический анализ проведен с использованием 479 геномов вируса бешенства, представленных в базе данных NCBI GenBank. Для построения дендрограммы применяли пакет программ BioNumerics 7.6. Результаты. Нуклеотидная последовательность генома вируса бешенства «Moscow 3253 (Vero)» депонирована в NCBI GenBank под номером MF630920. Геном вируса бешенства «Moscow 3253 (Vero)» в сравнении с его исходным вариантом имеет 1069 единичных мутаций. Установлена его филогенетическая близость к разнообразным вакцинным вариантам генома вируса бешенства представленных в базе данных NBCI GenBank, которые также адаптированы к клеточной культуре Vero или ВНК. Выявлено сильное влияние клеточной культуры Vero как среды репродукции вируса бешенства «Moscow 3253 (Vero)» на приобретение его геномом большого числа единичных мутаций. Заключение. Как отмечалось в ранее опубликованной работе, физико-химические и биологические свойства антирабического иммуноглобулина (АИГ), полученного по технологии с использованием штамма вируса бешенства «Moscow 3253 (Vero)», удовлетворяют требованиям нормативной документации на АИГ. Таким образом, использование вируса бешенства, адаптированного к клеточной линии Vero, для получения вакцины против бешенства имеет перспективу.

Авторы:

Издание: Молекулярная генетика ,микробиология и вирусология
Год издания: 2020
Объем: 7с.
Дополнительная информация: 2020.-N 4.-С.196-202. Библ. 15 назв.
Просмотров: 20