МЕХАНИЗМ УЧАСТИЯ MSX1 И РАХ9 В РАЗВИТИИ ЗУБОВ. РЕЗУЛЬТАТЫ АНАЛИЗА ВЗВЕШЕННЫХ СЕТЕЙ КО-ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ

Аннотация:

Изучен механизм участия генов Msxl и Pax9 в развитии зубов у мыши. Данные микрочипов GSE32321, которые содержали образцы орального эпителия (Epi) и зубных мезенхимальных клеток (Mes) мышей, экспрессирующих Msxl и Рах9 и нокаутных по данным генам, были использованы для идентификации дифференциально экспрессируемых генов (DEGs). Затем наиболее значимые генные модули были исследованы в группах Epi-Msx, Epi-Pax, Mes-Msx и Mes-Pax с помощью анализа взвешенных сетей ко-экспрессии генов (WGCNA). Анализ базы данных Gene Ontology (GO) и скрининг генов-центральных узлов регуляторной сети были выполнены на модулях с наибольшей релевантностью. Всего выявлено 1467, 986, 1212, и 1293 DEGs соответственно в группах Epi-Msx, Epi-Pax, Mes-Msx и Mes-Pax. Были идентифицированы четыре ассоциированных генных модуля. Применение метода анализа обогащения по функциональной принадлежности (база данных GO) позволило показать, что эти гены оказывают негативное регуляторное воздействие на пролиферацию клеток, клеточную адгезию, развитие кровеносных сосудов и морфогенез кровеносных сосудов. В качестве основных генов определены IDH3A, SSPN, F13A1 и CBLN1, уровень экспрессии которых варьировал в разные моменты времени. Более того, показано, что IDH3A и CBLN1 вовлечены в окислительно-восстановительные метаболические процессы с участием коэнзимов, а также в межклеточную адгезию. Мы предполагаем, что Msxl и Рах9 являются ключевыми, но не единственными регуляторами процесса формирования зубов у мышей. В этот процесс также могут быть вовлечены гены IDH3A, SSPN, F13A1 и CBLN1.

Авторы:

Издание: Онтогенез
Год издания: 2021
Объем: 13с.
Дополнительная информация: 2021.-N 3.-С.220-232. Библ. 0 назв.
Просмотров: 22