ПРОСТРАНСТВЕННАЯ СТРУКТУРА И РНК-СВЯЗЫВАЮЩИЕ СВОЙСТВА Lsm-БЕЛКА ИЗ Halobacterium salinarum

Аннотация:

В настоящей работе определена структура и исследованы РНК-связывающие свойства Lsm-белка археи Halobacterium salinarum, отличительной особенностью которого является короткая петля L4, соединяющая тяжи рЗ и р4. Поскольку бактериальные белки семейства Lsm, называемые Hfq, имеют короткую петлю L4 и образуют гексамеры, тогда как Lsm-белки архей, SmAP, имеют длинную петлю L4 и образуют гептамеры, было высказано предположение, что длина петли L4 может влиять на четвертичную структуру белков. Более того, петля L4 прикрывает область SmAP, соответствующую одному из сайтов связывания РНК в белках Hfq и, таким образом, может влиять на РНК-связывающие свойства белка. Наши результаты показывают, что SmAP из Н. salinarum формирует гептамеры и обладает теми же РНК-связывающими свойствами, что и гомологичные белки с длинной петлей L4. Следовательно, длина L4 не влияет на количество мономеров в Lsm-белках и на их РНК-связывающие свойства. Белки архей SmAP (Sm Archaeal Protein) относятся к семейству Lsm (Sm-like) белков, представители которого имеют характерную пространственную структуру пятитяжевого В-листа с N-концевой а-спиралью. Тяжи Р1, Р2 и рЗ составляют структурный мотив Sml, а тяжи (34 и Р5 — мотив Sm2. Эти участки белка соединены петлей L4, длина которой варьирует в Lsm-белках из разных организмов. Lsm-белки формируют четвертичную структуру в виде тороидальных колец, как правило, из 6 или 7 мономеров. Бактериальные Lsm-белки, называемые Hfq, образуют стабильные в растворе гомогексамеры. Эукариотические Lsm-белки характеризуются наличием ряда паралогов в различных клетках организма; они формируют гетерологичные гептамеры (Lsm 1—7 и Lsm2—8). В то же время Sm-белки эукариот организовывают гетерогептамеры только в присутствии специфически связываемых малых ядерных РНК и выполняют роль каркасных белков малых ядерных рибонуклеопротеинов (мяРНП).

Авторы:

Издание: Биохимия
Год издания: 2021
Объем: 11с.
Дополнительная информация: 2021.-N 7.-С.985-995. Библ. 28 назв.
Просмотров: 23