ПЕПТИДНЫЕ ИНГИБИТОРЫ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ РЕЦЕПТОР-СВЯЗЫВАЮЩЕГО ДОМЕНА ВИРУСА SARS-CoV-2 С КЛЕТОЧНЫМ РЕЦЕПТОРОМ АСЕ2

Аннотация:

Для выявления пептидов, имитирующих естественную мишень белка шипа (S) коронавируса SARS-CoV-2 — клеточный рецептор — ангиотензинпревращающий фермент типа 2 (АСЕ2), — было применено компьютерное моделирование. На основании структуры комплекса рецептор-связывающего домена (RBD) белка S с АСЕ2 осуществлён дизайн химерных молекул, состоящих из двух 22-23-членных пептидов, связанных друг с другом дисульфидными связями. Химерная молекула XI представляла собой дисульфидный димер, в котором S-S-связью были соединены краевые остатки цистеина в молекулах-предшественниках h1 и h2. В химерной молекуле Х2 линкерная связь находилась в середине молекулы каждого из пептидов-предшественников. Предшественники h1 и h2 имитировали аминокислотные последовательности фрагментов спиралей а1 и а2 внеклеточного пептидазного домена АСЕ2 соответственно, сохраняя большую часть аминокислотных остатков, участвующих во взаимодействии с RBD, неизменными. Целью работы была оценка эффективности связывания химерных молекул и входящих в их состав пептидов с RBD (в том числе в зависимости от серединного и краевого способов фиксации исходных пептидов h1 и h2). Предложенные полипептиды и химерные молекулы были синтезированы, очищены до 95-97% чистоты и охарактеризованы данными ВЭЖХ и масс-спектрометрии MALD1-TOF. Оценку связывания пептидов с RBD SARS-CoV-2 проводили с помощью микромасштабного термофореза с рекомбинантными доменами, соответствующими по последовательности исходному китайскому (GenBank ID NC-045512.2) и британскому (В.1.1.7, GISAID EPI-ISL-683466) вариантам. Связывание с RBD китайского варианта было выявлено у трёх синтезированных пептидов: линейного h2 и обоих химерных вариантов. Химерные пептиды также связывались с RBD британского варианта. Также была оценена противовирусная активность предложенных пептидов в культуре клеток Vera.

Авторы:

Издание: Биомедицинская химия
Год издания: 2021
Объем: 7с.
Дополнительная информация: 2021.-N 3.-С.244-250. Библ. 18 назв.
Просмотров: 17