Дальневосточный государственный медицинский университет Поиск | Личный кабинет | Авторизация
Поиск статьи по названию
Поиск книги по названию
Каталог рубрик
в коллекциюДобавить в коллекцию

РАЗРАБОТКА ПРОТИВОВИРУСНЫХ ЛЕКАРСТВ НА ОСНОВЕ ИНГИБИТОРОВ ГЛАВНОЙ ПРОТЕАЗЫ SARS-CoV-2


Аннотация:

Был проведён виртуальный скрининг с использованием докинга и методов квантовой химии лекарственно-подобных соединений базы данных Воронежского университета против главной протеазы коронавируса SARS-CoV-2, вызвавшего пандемию COVID-19. Сначала был выполнен докинг более 42 тысяч трёхмерных структур лигандов с помощью программы SOL. Далее, на основании оценки свободной энергии связывания, вычисляемой с помощью программы докинга SOL, было отобрано более тысячи лигандов для вычисления энтальпии связывания белок-лиганд с помощью квантово-химического полуэмпирического метода РМ7 с учётом растворителя (воды) в неявной модели COSMO. В результате для экспериментального тестирования было отобрано 20 лигандов, показавших лучшие значения функции оценки свободной энергии связывания, вычисленной программой SOL, и энтальпии связывания, вычисленной квантово-химическим методом. В ходе экспериментального тестирования измеряли ингибирующую активность соединений против главной протеазы SARS-CoV-2 и подавление репликации этого коронавируса в культуре клеток. Ингибирование определяли с использованием пептидного субстрата с флуоресцентной меткой, включающей сайт протеолиза главной протеазы. Антивирусную активность тестировали в культуре клеток Vero. В результате экспериментального тестирования 8 молекул показали активность по ингибированию главной протеазы SARS-CoV-2 в субмикромолярном и микромолярном диапазонах IС50, и 3 из них подавляли репликацию SARS-CoV-2 в культуре клеток на уровне микромолярных значений ЕС50 и имели низкую цитотоксичность. Найденные химически разнообразные ингибиторы могут быть использованы для оптимизации с целью получения соединения-лидера — основы новых антивирусных препаратов прямого действия на коронавирус SARS-CoV-2.

Авторы:

Сулимов А.В.
Шихалиев Х.С.
Пьянков О.В.
Щербаков Д.Н.
Чиркова В.Ю.
Ильин И.С.
Кутов Д.К.
Тащилова А.С.
Крысин М.Ю.
Крыльский Д.В.
Столповская Н.В.
Волосникова Е.А.
Беленькая С.В.
Сулимов В.Б.

Издание: Биомедицинская химия
Год издания: 2021
Объем: 9с.
Дополнительная информация: 2021.-N 3.-С.259-267. Библ. 26 назв.
Просмотров: 24

Рубрики
Ключевые слова
cos
covid-19
sars-cov-2
vero
активность
антивирусная
базы
белокЕ7
биомедицина
болезни
болеющие
бытовые
виртуальный
включения
вода
воронежская
выполнение
главные
даль
данные
действие
диапазона
значению
ингибирование
ингибирующий
ингибитор
ингибиторы
инфекции
инфекционные
использование
использованием
квантовая
клеток
ключ
коронавирус
коронавирусные
культур
лекарства
лекарственна
лекарство
лиганды
метка
метод
методов
микробы
модели
молекула
низкие
новые
оптимизация
основа
основание
оценка
пандемия
пептидной
подавление
пола
получение
помощи
препараты
программ
протеаз
протеазы
протеолиза
против
противовирусная
противовирусные
прямая
разнообразные
разработка
растворители
результата
репликация
сайт
свободное
связывание
скрининг
слова
соединение
создание
средства
структур
субстратов
тестирование
тестирования
университет
уровни
флуоресцентная
функции
химические
химия
целью
цитотоксичность
экспериментальная
энергия
энтальпия
Ваш уровень доступа: Посетитель (IP-адрес: 3.147.62.99)
Яндекс.Метрика