ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ПАКЕТА MALDIquant ДЛЯ ПРОГРАММНОЙ СРЕДЫ R В МАСС-СПЕКТРОМЕТРИЧЕСКОМ АНАЛИЗЕ АНТИБИОТИКОРЕЗИСТЕНТНЫХ S. AUREUS И P. AERUGINOSA

Аннотация:

С целью изучения возможности выявления отличий в масс-спектрах чувствительных и устойчивых к антибиотикам штаммов бактерий с помощью программной среды R и пакета MALDIquant проанализировано 8 штаммов P. aeruginosa и 9 штаммов S. aureus. Для каждого вида было отобрано по одному чувствительному и одному резистентному к антибиотикам штамму. Устойчивость изучалась по отношению к азитромицину, меропенему, ципрофлоксацину, амикацину, цефиксиму и цефотаксиму. Масс-спектры бактерий строились с помощью MALDI-TOF масс-спектрометра microflex (Bruker, Германия). Для предварительной обработки масс-спектров, использовался пакет программной среды R — MALDIquant. Для каждой бактерии было отобрано по 5 областей спектра вероятно ответственных за резистентность к антибиотикам. Установлено, что наличие пиков в областях m / z = 5383, 6977, 4882, 3005, 6621 спектров P. aeruginosa и m / z = 3876, 6556, 12542 спектров S. aureus может свидетельствовать об их антибиотикорезистентности.

Авторы:

Издание: Дальневосточный журнал инфекционной патологии
Год издания: 2021
Объем: 10с.
Дополнительная информация: 2021.-N 40.-С.56-65. Библ. 12 назв.
Просмотров: 20