Изменчивость генома холерных вибрионов Эль Тор, выделенных до начала и в разные периоды текущей пандемии холеры

Аннотация:

Нестабильность генома возбудителя холеры приводит к появлению его новых вариантов с измененными эпидемически значимыми свойствами. Это определяет актуальность исследования динамики изменений структуры генов патогенности и персистенции холерных вибрионов, выделенных через длительные периоды времени. Материал и методы. Биоинформационный анализ нуклеотидных последовательностей полных геномов 44 токсигенных и нетоксигенных штаммов V. cholerae Ol биовара Эль Тор, выделенных до начала и в разные периоды текущей пандемии, среди которых 29 было выявлено в России. Для SNP-типирования использовали алгоритм Байесовского эволюционного анализа с применением программы BEAST v2.5.1. Результаты и обсуждение. На основе SNP-анализа показано, что занос эпидемически опасных штаммов в Россию (1970— 2014 гг.) совпадал с временным периодом трех различных волн глобального распространения холеры в мире. Сравнение нуклеотидных последовательностей участков генома холерных вибрионов, определяющих вирулентность и способность к эпидемическому распространению, подтвердило многоступенчатость и быстроту их изменения. Впервые установлено, что геномы островов патогенности VPI-1 и VPI-2 предпандемических штаммов содержат различные мутации, которые отличают их от генома пандемических штаммов. В то же время выявлена консервативность нуклеотидной последовательности всех изученных генов персистенции из VPI-2 и EPI пандемических изолятов. Напротив, у современных нетоксигенных штаммов ctxA-tcpA- обнаружена существенная вариабельность генов персистенции, входящих в состав этих мобильных элементов. Заключение. Новые данные о структуре участков генома холерных вибрионов, связанных с персистенцией, могут быть использованы для дифференциации холерных вибрионов с разной эпидемической значимостью.

Авторы:

Издание: Молекулярная генетика ,микробиология и вирусология
Год издания: 2021
Объем: 13с.
Дополнительная информация: 2021.-N 2.-С.25-37. Библ. 27 назв.
Просмотров: 23