Экспрессия изоформ рецептора CD44 в клеточных линиях колоректального рака

Аннотация:

На основании данных, представленных в базе Cancer Cell Line Encyclopedia по секвенированным последовательностям мРНК, проведен анализ паттернов экспрессии вариантов мРНК, кодирующих изоформы белка CD44, в 55 клеточных линиях колоректального рака (КРР). Показано, что распределение изоформ мРНК CD44 значительно различается между линиями КРР. В 13 исследованных линиях, включая Сасо-2 и RKO, экспрессия CD44 не зарегистрирована. Для большинства остальных линий изоформа 3 мРНК CD44 является наиболее представленной, однако уровень ее экспрессии варьирует, а в линиях MDST8 и SNU503 отсутствует. Самый высокий уровень экспрессии изоформы 3 наблюдается в линиях CW2 и T84. Следующая по частоте встречаемости — изоформа 4, при этом уровень ее экспрессии ниже такового для изоформы 3, кроме линий HCT116, SNU81, NCIH508 и SNUC4. Наиболее высокая экспрессия изоформы 4 обнаружена в линии MDST8 — единственной линии, в которой экспрессируется изоформа 6. Также в клеточных линиях КРР представлена изоформа 2 мРНК CD44, наиболее высокий уровень экспрессии которой обнаружен в линии SNU503. Экспрессия изоформ 1,5 и 7 не обнаружена ни в одной из исследуемых линий. При выборе клеточной модели для исследования роли CD44 при КРР необходимо учитывать профиль экспрессии мРНК конкретных изоформ этого белка.

Авторы:

Издание: Биотехнология
Год издания: 2021
Объем: 6с.
Дополнительная информация: 2021.-N 6.-С.95-100. Библ. 25 назв.
Просмотров: 19