Геномные характеристики штаммов Achromobacter spp., выделенных от пациентов с муковисцидозом в России

Аннотация:

Цель. Определить виды и сиквенс-типы изолятов Achromobacter spp., выделенных от пациентов с муковисцидозом (MB) в России, а также выявить среди этих изолятов носительство и интегронную организацию генов вирулентности и адаптивной резистентности. Материалы и методы. В качестве объекта исследования использовали штаммы рода Achromobacter, выделенные из мокроты и верхних дыхательных путей 168 пациентов с MB. Все изоляты были подвергнуты полногеномному секвенированию на платформе MGISEQ-2000, MGI с последующей биоинформатической обработкой при помощи стандартных программ. Результаты. Achromobacter spp. был выделен у 16 из 168 (5,3%) обследованных пациентов с MB; у двоих пациентов было выделено по 2 штамма. Наиболее распространенным видом оказался A. xylosoxidans (13/18, 72%). Штаммы характеризовались высоким сиквенс-типовым разнообразием: всего было выявлено 14 сиквенс-типов, из которых 8 оказались новыми. Большинство выделенных штаммов обладали типичным для ахромобактерий набором факторов вирулентности. Носительство генов адаптивной резистентности было редким феноменом (1 из 18 изолятов) для бактерий рода Achromobacter, выделенных от пациентов с MB в России. Выводы. Среди пациентов с MB в России показатели колонизации дыхательной системы бактериями рода Achromobacter соответствовали данным, зарегистрированным в других странах мира. Наиболее распространенным видом оказался A. xylosoxidans (72% от всех изолятов Achromobacter). Штаммы характеризовались высоким сиквенс-типовым разнообразием. Большинство выделенных штаммов обладали типичным для ахромобактерий набором факторов вирулентности. Носительство генов адаптивной резистентности было редким феноменом.

Авторы:

Издание: Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия
Год издания: 2021
Объем: 6с.
Дополнительная информация: 2021.-N 3.-С.220-225. Библ. 35 назв.
Просмотров: 14