РАЗРАБОТКА ТЕСТ-СИСТЕМЫ ДЛЯ ВЫЯВЛЕНИЯ ОМИКРОН-ВАРИАНТА SARS-CoV-2 И ЧАСТОТА ЕГО ОБНАРУЖЕНИЯ У ПАЦИЕНТОВ

Аннотация:

Разработана новая тест-система мониторинга омикрон-варианта SARS-CoV-2 на основе аллель-специфической ПЦР с обратной транскрипцией и определена частота обнаружения этого варианта в образцах SARS-CoV-2-положительных пациентов, проживающих в Новосибирской области. Полученные образцы разделяли на три группы, собранные в период с 1 по 30 декабря 2021 г. (1-я; n=66), с 30 декабря 2021 г. по 10 января 2022 г. (2-я; n=20) и с 11 по 22 января 2022 г. (3-я; n=101). На основе выявления 5 мутаций, специфичных для SARS-CoV-2 (В.1.1.529), разработаны два набора олигонуклеотидных праймеров и зондов для выявления данного генотипа коронавируса в клинических образцах. Предел обнаружения (LOD95) составил 4х103 геном эквивалентов на 1 мл клинического образца для 1-го набора праймеров и 2x103 геном эквивалентов для 2-го набора праймеров. Омикрон-вариант SARS-CoV-2 не был выявлен в 1-й группе образцов, во 2-й группе обнаружен в 20% (4/20) образцов, а в 3-й группе — в 88% образцов, собранных менее чем за 2 нед в январе 2022 г. При использовании разработанных наборов показано, что менее чем за 2 нед омикрон-вариант стал доминирующим у пациентов, что подтверждает ранее опубликованные данные о его исключительной контагиозности.

Авторы:

Издание: Бюллетень экспериментальной биологии и медицины
Год издания: 2022
Объем: 7с.
Дополнительная информация: 2022.-N 2.-С.205-211. Библ. 15 назв.
Просмотров: 20