Иммуногенетический профиль локусов, сцепленных с главным комплексом тканевой совместимости МНС (HLA) - MIC (MICA, MICB) у русских Челябинской области

Аннотация:

Гены MIC расположены на 6-й хромосоме в регионе главного комплекса гистосовместимости (МНС) Г класса и кодируют связанный с мембраной стресс-индуцибельный белок, действующий как лиганд для стимуляции активирующего рецептора, NKG2D, экспрессируемого на поверхности практически всех естественных киллеров человека (NK). На данный момент известно 7 локусов MIC, из которых только MICA и MICB кодируют белковые продукты и обладают существенным аллель-ным полиморфизмом. Полиморфизм генов М 1С и их расположение в регионе HLA на 6-й хромосоме предполагает наличие этнических и межпопуляционных различий в частотах генов, неравновесном сцеплении локусов и в частотах HLA-MIC гаплотипов, что дает возможность получать информацию о генетическом родстве популяций. Целью нашего исследования является представить иммуногенетический профиль популяции русских Челябинской области на основе неклассических локусов HLA — MICA и MICB, в контексте мировых популяций. Проведено иммуногенетическое типирование 100 доноров состоящих в Регистре доноров стволовой клетки ГБУЗ «Челябинской областной станции переливания крови», идентифицирующих себя русскими, по 2 локусам MICA и MICB на базовом разрешении, методом полимеразной цепной реакции с сиквенс-специфическими праймерами (SSP-PCR). С помощью программы для иммуногенети-ческих исследований Arlequin 3.5 были рассчитаны частоты генов (GF). В популяции русских Челябинской области установлены, следующие характеристики профиля генов MICA (М1СА*008, *002, *010, *009 с частотой больше 7%; средние частоты М1СА*004, *007, *018, *017 и М1СА*027, *011, *006, *009:02, *049, *012, *016 с частотой меньше 3,5%), а также профиля генов MICB (М1СВ*005:02, *004, *002, *008 с частотой больше 6%; с частотой 4% М1СВ*003, *005:03; MICB*005:01, *005:04, *009N, М1СВ*013, *014 с частотой 0,5%). На основе расчета генетических расстояний (по Нею) по локусу MICA построена дендрограмма и график рассеяния с использованием метода многомерного шкалирования (MDS), на которых представлено расположение 30 мировых популяций, включая данные по популяции русских Челябинской области. Наименьшие генетические дистанции между популяцией русских Челябинской области и рассмотренными мировыми популяциями обнаружены между жителями Словении, а также населением США европейского происхождения. В результате построения графика рассеяния на основании частот генов MICA методом MDS, с использованием данных кластерного анализа, было установлено, что популяция русских Челябинской области принадлежит к кластеру типичных европейских популяций. Полученные закономерности могут быть использованы в практической работе для создания регистра доноров стволовых клеток России. Кроме того, данные могут быть использованы как контрольная группа для проведения исследований по направлению «ассоциация HLAc заболеваниями», а также востребованы специалистами по этногенезу в популяционных исследованиях.

Авторы:

Издание: Медицинская иммунология
Год издания: 2022
Объем: 12с.
Дополнительная информация: 2022.-N 1.-С.41-52. Библ. 27 назв.
Просмотров: 18