Молекулярно-генетические основы различий подвидов возбудителя туляремии и типирования штаммов Francisella lularensis subsp. holarctica

Аннотация:

Сравнение секвенированных геномов штаммов вирулентных для человека и животных подвидов возбудителя туляремии F. tularensis subsp. tularensis, holarctica и mediasiatica показывает высокую геномную гомологию — от 99,26 до 99,98%. Каждый год предлагается новая усовершенствованная схема полногеномной филогении, особенно подвида F. tularensis subsp. holarctica, который при широком распространении в мире показывает низкое генетическое разнообразие. В связи с ограниченной генетической вариабельностью геномов F. tularensis subsp. holarctica секвенирование, а также методы определения числа тандемных повторов (MLVA) и выявления замен отдельных нуклеотидов (SNPs), делеиий и вставок (INDELs) в последовательности ДНК остаются предпочтительными генетическими инструментами для молекулярного типирования штаммов внутри подвида. Текущая схема типирования штаммов подвида F. tularensis subsp. holarctica определяет четыре основные филогенетические группы штаммов (В.4, В.6, В.12 и В. 16) и свыше 300 отдельных генотипических популяций в пределах этого подвида, которые отличаются друг от друга несколькими специфическими однонуклеотидными заменами и лелеииями. Ключевые слова: Francisella tularensis, подвиды, типирование, замена отдельных нуклеотидов, делеции, вставки.

Авторы:

Издание: Молекулярная генетика ,микробиология и вирусология
Год издания: 2022
Объем: 9с.
Дополнительная информация: 2022.-N 1.-С.12-20. Библ. 45 назв.
Просмотров: 21