МОДЕЛИРОВАНИЕ СТРУКТУРЫ КОМПЛЕКСА тРНК-ГУАНИНТРАНСГЛИКОЗИЛАЗЫ ЧЕЛОВЕКА С 7-МЕТИЛГУАНИНОМ И ВЫЯВЛЕНИЕ ФАКТОРОВ, ОПРЕДЕЛЯЮЩИХ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ ФЕРМЕНТА С ИНГИБИТОРАМИ

Аннотация:

тРНК-Гуанинтрансгликозилаза, катализирующая замену гуанина на кьюин в тРНК человека и участвующая в механизме трансляции, вовлечена в развитие рака, однако информация о низкомолекулярных ингибиторах, способных подавлять активность данного фермента, весьма ограничена. С помощью молекуляр-но-динамических симуляций определены аминокислотные остатки, обеспечивающие эффективное связывание ингибиторов в активном центре тРНК-гуанинтрансгликозилазы. На примере молекулы 7-метил-гуанина продемонстрировано, что ключевую роль в комплексообразовании играет способность ингибитора переходить в заряженную форму в окружении остатков Aspl05 и Aspl59, являющихся акцепторами водородных связей. Также имеет значение формирование водородных связей и гидрофобных контактов с остатками Gln202, Gly229, Phel09 и Met259. Предсказано, что введение заместителей будет по-разному влиять на способность ингибировать тРНК-гуанинтрансгликозилазу, а также белок репарации ДНК поли(АОР-рибозо)полимеразу 1, что может способствовать созданию более эффективных и селективных соединений.

Авторы:

Издание: Биохимия
Год издания: 2022
Объем: 8с.
Дополнительная информация: 2022.-N 4.-С.550-557. Библ. 44 назв.
Просмотров: 17