КОНСТРУИРОВАНИЕ СИСТЕМЫ АЛЛЕЛЬСПЕЦИФИЧЕСКОИ ПЦР В РЕЖИМЕ РЕАЛЬНОГО ВРЕМЕНИ ДЛЯ ОПРЕДЕЛЕНИЯ ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКОЙ ПРИНАДЛЕЖНОСТИ ШТАММОВ Yersinia pestis

Аннотация:

Вид Yersinia pestis характеризуется низким генетическим разнообразием, при этом обладает высоким уровнем различий в вирулентности и эпидемической значимости. На территории России и соседних государств циркулируют штаммы многих филогенетических ветвей возбудителя чумы, что указывает на необходимость совершенствования эпидемиологического контроля. Нами предпринята попытка разработки системы быстрой и надежной идентификации штаммов Yersinia pestis по их филогенетической и филогеографической принадлежности. Для этого была конструирована система аллельспецифической ПЦР (АС-ПЦР) в режиме реального времени для определения филогенетической принадлежности штаммов Y. pestis. Эффективность разработанной системы оценивали на 114 штаммых Y. pestis разных филогенетических ветвей. Применение АС-ПЦР в режиме реального времени в комплексе с ранее созданными тестами ПЦР в режиме реального времени позволяет существенно повысить оперативность и эффективность молекулярной идентификации выделяемых штаммов Y. pestis непосредственно в очагах чумы в рамках мониторинга эндемичных территорий, а также при проведении эпидемиологического расследования вспышек или случаев заноса штаммов Y. pestis на территорию Российской Федерации.

Авторы:

Издание: Биотехнология
Год издания: 2022
Объем: 10с.
Дополнительная информация: 2022.-N 3.-С.82-91. Библ. 36 назв.
Просмотров: 15