АЛЛЕЛЬНЫЙ ПОЛИМОРФИЗМ ГЕНОВ ФАКТОРОВ ПАТОГЕННОСТИВОЗБУДИТЕЛЯ СИБИРСКОЙ ЯЗВЫ КАК МЕТОД ОЦЕНКИ МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИХ РИСКОВ ПРИ ИЗМЕНЕНИИ КЛИМАТА

Аннотация:

Климатические изменения приводят к появлению рисков возникновения особо опасных инфекций. На примере изучения аллельного полиморфизма генов факторов патогенности возбудителя сибирской язвы показана возможность оценки патогенного потенциала бактерий, что является необходимым условием оценки микробиологических рисков. Впервые исследован аллельный полиморфизм capBCADE-оперона (гены capВ, сарС, cap A, capD, сарЕ), кодирующего белки биосинтеза капсулы Bacillus anthracis, и генов асрА и асрВ, кодирующих регуляторы экспрессии этого оперона. У штаммов исследуемой выборки описан ряд однонуклеотидных замен (SNP): 5 SNP в гене сарВ, 3 в сарС, 4 в cap А, 14 в capD, 2 в сарЕ, 15 в асрВ, а также 7 SNP и одна инсерция в гене асрА. В результате выборка разбита на сиквенс-типы по каждому гену и 17 генотипов, которые являются комбинациями выявленных сиквенс-типов. Трансляция in silico обнаруженных аллелей исследуемых генов позволила выявить у белков СарВ и СарА по 3 изоформы, у белков СарС и СарЕ — по 2 изоформы, 6 изоформ у белка CapD, 5 у АсрА и 4 у АсрВ. Обнаружено, что SNP сарС 351А —> G является маркером штаммов группы A.Br.Aust94. Штаммы группы A.Br.Vollum согласно результатам делятся на две подгруппы. Штаммы эволюционных линий В и С отличались от штаммов линии А наличием SNP асрА 853G —> А. Обнаружен ранее не описанный вариабельный тандемный нуклеотидный повтор — VNTR (Variable Number Tandem Repeat) в гене асрА и показана возможность его использования для дифференцирования и генотипирования штаммов В. anthracis.

Авторы:

Издание: Прикладная биохимия и микробиология
Год издания: 2022
Объем: 14с.
Дополнительная информация: 2022.-N 4.-С.338-351. Библ. 32 назв.
Просмотров: 16