ИДЕНТИФИКАЦИЯ МУТАЦИЙ ПОВЕРХНОСТНОГО ГЛИКОПРОТЕИНА SARS-CoV-2 В ШТАММАХ, ИЗОЛИРОВАННЫХ В ИРАКЕ

Аннотация:

Глобальная пандемия коронавирусной инфекции стала длительной кризисной ситуацией да общества, экономики и здравоохранения, которая продолжается и сейчас. Спайк-гликопротеин вируса SARS-CoV-2 является одним из первичных компонентов вирулентности, тканевого тропизма и объектов носительства. Целью работы было определение мутаций S-белка в изолятах от больных CОVID-19 в Ираке. Методы: полногеномные последовательности линий вируса в Ираке получали из базы GISAID. Используя статистики сатурационного мутагенеза и другие методики биинформатики, мы изучили 20 последовательностей изолятов SARS-CoV-2 с миссенс-мутацией данного белка, выявленных в Ираке и выбранных из базы данных NCBI. В результате во всех линиях вируса, при сравнении с диким типом, были выявлены следующие мутации: L452R, A522V, E583D and D614G. Число мутаций этих линий было различным, в зависимости от места сбора образцов. Мутация D614G была обнаружена в 19 линиях. Одна из линий имела 3 мутации, тогда как другая относились к дикому типу вируса. Структура мутантного белка существенно изменяется из-за энергетических взаимодействий атомов в зоне стыковки, что влияет на стабильность белка. Выводы: стабильность S-белка может изменяться в зависимости от места мутации. Стыковка молекулы RBD-ACE2 нарушается по-разному при заменах аминокислот L452R and A522V.

Авторы:

Издание: Медицинская иммунология
Год издания: 2022
Объем: 12с.
Дополнительная информация: 2022.-N 4.-С.729-740. Библ. 38 назв.
Просмотров: 12