Дальневосточный государственный медицинский университет Поиск | Личный кабинет | Авторизация
Поиск статьи по названию
Поиск книги по названию
Каталог рубрик
в коллекциюДобавить в коллекцию

Молекулярно-генетическая характеристика штаммов Vibrio cholerae nonO1/nonO139, выделенных от больных отитами на территории Российской Федерации


Аннотация:

В 2017-2020 гг. в России впервые за много лет от больных отитами были выделены штаммы Vibrio cholerae non01/non0139 (НАГ-вибрионов). Цель работы — биоинформационный анализ полных геномов (WGSs) и отдельных генов штаммов НАГ-вибрионов — возбудителей отитов, выделенных в России. Материалы и методы. Анализ WGSs 8 клинических изолятов НАГ-вибрионов, полученных на платформе «MiSeq IIIumina», проводили с использованием программ «BioEdit», «BLASTN», «BLASTP», «Vector NTI»; антибиотикоустойчивость определяли согласно МУК 4.2.2495-09. Результаты. Штаммы различались по содержанию SNP, наборам детерминант факторов патогенности/персистенции и их аллелям. Все были лишены профагов СТХ, preCTX, RS1, острова патогенности VPI, гена термостабильного токсина, мобильных элементов, связанных с антибиотикорезистентностью, острова пандемичности VSP-I; 2 штамма содержали остров VSP-II. В разных сочетаниях выявлены гены ряда протеаз, cholix-токсина, кластер системы секреции 3-го типа (T3SS), дополнительные кластеры T6SS. Продукты изменённых генов сохраняли либо утрачивали характерные активные домены. В цитотоксине MARTX 6 штаммов отсутствовал ключевой домен ACD, у 4 выявлен новый домен rtxA-like. Кластеры генов биоплёнкообразования варьировали по стуктуре. Присутствие генов антибиотикорезистентности не всегда коррелировало с антибиотикограммами. Все штаммы были чувствительны к большинству антибиотиков, но некоторые проявляли резистентность к 1-4 препаратам. Обсуждение. Все изученные штаммы — возбудители отитов, несмотря на выявленные различия, обладают достаточными наборами детерминант, ответственных за реализацию патогенетического и персистентного потенциала. В связи с несовпадением генотипических и фенотипических показателей антибиотикорезистентности при выборе препаратов для этиотропной терапии НАГ-инфекций следует полагаться в основном на фенотип. Заключение. Выявление на территории России больных отитами, вызыванными НАГ-вибрионами, указывает на целесообразность включения тестов на их присутствие в схему бактериологического анализа при внекишечных инфекциях и в случаях их выделения — оперативного определения чувствительности к антибиотикам.

Авторы:

Монахова Е.В.
Водопьянов А.С.
Крутиков В.Д.
Селянская Н.А.
Писанов Р.В.
Носков А.К.

Издание: Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии
Год издания: 2022
Объем: 13с.
Дополнительная информация: 2022.-N 4.-С.465-477. Библ. 30 назв.
Просмотров: 12

Рубрики
Ключевые слова
cho
cholerae
vibrio
активные
аллеля
анализ
антибиотик
антибиотикограммы
антибиотикорезистентность
антибиотикоустойчивость
бактериология
биоинформатика
больные
большая
варьирующая
включениями
внекишечный
возбудители
впервые
выбор
выделение
вызывать
выявленный
гена
генетика
генов
геном
генотип
гены
детерминанты
домен
домены
дополнительные
изменения
изоляты
изучению
инфекцией
использование
кластер
клиническая
ключ
корреляты
лет
материал
метод
мобильность
молекулярная
набор
новые
оперативная
определение
основной
остров
ответ
отдельные
отит
пандемия
патогенетическая
патогенность
персистенции
платформа
показатели
пола
полная
полногеномная
потенциал
препараты
программ
продуктов
протеаз
проявления
работа
различие
реализация
резистентность
результата
россии
российская
ряда
связанные
связей
секреции
систем
след
слова
случаев
содержание
схема
терапия
термостабильный
территории
тестовые
типа
токсин
указ
фактор
федерации
федерация
фенотип
фенотипические
формы
характеристика
характерного
целесообразность
цель
цитотоксины
чувствительность
чувствительные
штамм
штаммы
элементы
этиотропная
Ваш уровень доступа: Посетитель (IP-адрес: 34.204.176.71)
Яндекс.Метрика