ВАРИАЦИИ В НУКЛЕОТИДНОЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ГЕНА МТР4 У РАСТЕНИЙ-РЕГЕНЕРАНТОВ САХАРНОЙ СВЕКЛЫ

Аннотация:

Цель работы — изучение молекулярных вариаций семи экзонов гена МТР4 (metal tolerance protein 4) и корреляции между уровнем экспрессии данного гена и устойчивостью/чувствительностью генотипов сахарной свеклы к кадмию. МТР4 находится на хромосоме 3 и ассоциирован с устойчивостью растений сахарной свеклы к тяжелым металлам. Материалами для исследований служили растения — микроклоны, выращенные в культуре in vitro на селективной среде с ионами кадмия в концентрации 6 мМ, в качестве селективного агента использовали ацетат кадмия — Cd(CH3COO)2. Для экспериментов в культуре in vitro были отобраны устойчивые и чувствительные микроклоны по морфологическим признакам. Для проведения классического варианта ПЦР использованы семь пар праймеров, сконструированных к каждому экзону. В результате получены ДНК-ампликоны длиной ~390, 381, 344, 299, 304, 334 и 337 п.н. С помощью ПЦР в реальном времени с использованием одной пары праймеров оценили относительный уровень экспрессии гена МТР4 в изучаемых образцах. С использованием биоинформатических инструментов Snap Gene и Geneious Prime для анализа се-квенированных последовательностей гена МТР4 описаны однонуклеотидные полиморфизмы (SNPs), инсерции и делеции в гене МТР4, получены дедуктивные аминокислотные последовательности, кодируемые полиморфными вариантами экзонов. Для экзона-1 показана филогенетическая близость образцов 2 (МС 2113), 6 (ОП 010) и 10 (ОП 15465). Выявлен высокий полиморфизм во всех эк-зонах, за исключением экзона-6, где идентифицирована одна вставка и три SNPs: Т/С, G/T и Т/С — в позициях 30, 60 и 96. Все три замены относятся к синонимичным. Четкой корреляции показателей экспрессии между резистентными и чувствительными к ионам кадмия образцами не обнаружено.

Авторы:

Издание: Биотехнология
Год издания: 2022
Объем: 9с.
Дополнительная информация: 2022.-N 4.-С.23-31. Библ. 23 назв.
Просмотров: 14