In house метод ускоренной идентификации грибов из положительной гемокультуры с помощью матричной лазерной десорбционной ионизационной времяпролетной масс-спектрометрии у больных с инфекцией кровотока

Аннотация:

Цель. Представить результаты применения in house метода ускоренной идентификации грибов из положительной гемокультуры в сравнении с «классическим» методом, используя матрично-активированную лазерную десорбционную ионизационную времяпролетную (MALDI-TOF) масс-спектрометрию у больных с инфекцией кровотока. Материалы и методы. Проспективное исследование было проведено с 2016 по 2019 г. в ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России. Кровь для микробиологического исследования брали в коммерческие флаконы с жидкой питательной средой, предназначенной для культивирования микроорганизмов в автоматическом анализаторе для гемокультур ВАСТЕС FX (Becton Dickinson, США). После сигнала прибора о наличии положительной гемокультуры проводили микроскопию препарата с окрашиванием по Граму. При выявлении дрожжевых клеток или мицелия грибов использовали одновременно ускоренный in house и «классический» метод идентификации микроорганизмов с помощью MALDI-TOF масс-спектрометрии на анализаторе Microflex LT (Bruker Daltonics, Германия). Для проведения ускоренного метода идентификации кровь из флакона с положительной гемокультурой переносили в пробирку, центрифугировали и проводили экстракцию белков грибов раствором додецилсульфата натрия. «Классический» метод заключался в исследовании положительной гемокультуры на плотных питательных средах Сабуро с хлорамфениколом (bioMerieux, Франция) - для дрожжеподобных грибов и Сабуро с декстрозой (Oxoid, Великобритания) - для мицелиальных грибов. Результаты. Всего было получено 16 положительных гемокультур, из которых в монокультуре были выделены 14 (87,5%) Candida spp.: С. parapsilosis (n=5), С. tropicalis (n=4), С. albicans (n=3), С. krusei (n=1), C. guilliermondii (n=1), один (6,3%) Rhodotorula mucilaginosa и один (6,3%) Fusarium dimerum. Ускоренным in house методом была проведена успешная верификация до рода 75%(12/16) изолятов, до вида - 68,8%(11/16). Результаты идентификации исследуемых грибов до рода и вида ускоренным методом полностью совпали с идентификацией «классическим» способом. Медиана времени от постановки флакона в автоматический анализатор до идентификации грибов ускоренным in house методом была статистически значимо короче в сравнении с «классическим» методом и составила 36 ч. 20 мин. против 55 ч. 31 мин. соответственно (р=0,028). Выводы. Отмечен высокий процент успешных видовых идентификаций и сокращение времени до верификации грибов из положительной гемокультуры с помощью ускоренного in house метода. Предложенный способ следует использовать в реальной практике микробиологических лабораторий с целью сокращения времени представления результатов в клинические отделения.

Авторы:

Издание: Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия
Год издания: 2022
Объем: 9с.
Дополнительная информация: 2022.-N 2.-С.171-179. Библ. 23 назв.
Просмотров: 16