От биоинформационного скрининга генетических маркёров к малоинвазивной диагностике метастазов в лимфатических узлах у пациенток с раком шейки матки

Аннотация:

Актуальность. Проблема диагностики метастазов в лимфатических узлах при раке шейки матки остаётся актуальной и до конца не решённой. Результаты исследований последнего десятилетия показали большой потенциал молекулярных маркёров в предсказании метастазирования в лимфатические узлы, однако необходимы дополнительные исследования для их внедрения в клиническую практику. Цель. Биоинформационный и лабораторный скрининг молекулярных маркёров регионарного метастазирования опухолей шейки матки для разработки методов его малоинвазивной диагностики. Материал и методы исследования. Исследование выполнено на 400 больных раком шейки матки и 40 донорах без онкологической патологии. Для идентификации потенциальных молекулярных маркёров метастатического поражения лимфатических узлов первично проводили анализ базы данных The Cancer Genome Atlas. Выявленные маркёры валидировали методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени в образцах опухолевых клеток (извлечены с помощью лазерной микродиссекции) и внеклеточной дезоксирибонуклеиновой кислоты (ДНК). Для оценки различий применяли критерий Манна-Уитни, для учёта множественного сравнения использовали поправку Бонферрони. Результаты. На биоинформационном этапе было проанализировано изменение копийности 5493 генов, из них было выбрано 79 генов, наиболее часто изменяющих свою копийность. При валидации данных было установлено, что клетки первичной опухоли и опухолевые клетки метастазов из лимфатических узлов отличаются по уровню копийности генов от нормальных клеток шейки матки. Показатель копийности генов CCND1 и PPARGC1A имеет наивысший потенциал для диагностики метастазов в регионарные лимфатические узлы у больных раком шейки матки, меньшим потенциалом обладают локусы PIK3CA, SPEN, ERBB3, АРС, MUC4, CASP8, HLA-A, IGSF1 и ТМТС1. Гены ЕР300, TTN, DMD, DST. LAMP3, TORC2, ТР53 и FOXO3 можно использовать для диагностики рака шейки матки независимо от его формы — метастатической или нет. На внеклеточной ДНК плазмы крови больных раком шейки матки и условно здоровых доноров проведена дополнительная валидация маркёров. Установлено наличие дифференциального показателя копийности генов PIK3CA, SPEN, ERBB3, АРС, CCND1, HLA-A, TTN, MUC4, DST, PPARGC1A в двух группах больных раком шейки матки с метастатическим поражением лимфатических узлов и без него. Вывод. Проведённое исследование позволило сформировать перечень потенциальных молекулярных маркёров для малоинвазивной диагностики как рака шейки матки в целом (ЕР300, LAMP3, TORC2, FOXO3, ТР53), так и рака шейки матки с метастатическим поражением регионарных лимфатических узлов (Р1КЗСА/ DST, APC/PPARGC1A, ERBB3/HLA-A и LAMP3/MUC4).

Авторы:

Издание: Казанский медицинский журнал
Год издания: 2022
Объем: 12с.
Дополнительная информация: 2022.-N 5.-С.725-736. Библ. 21 назв.
Просмотров: 15