ОНЛАЙН-СЕРВИС ДЛЯ АВТОМАТИЗИРОВАННОЙ ИНТЕРПРЕТАЦИИ ДАННЫХ СЕКВЕНИРОВАНИЯ И ПРОГНОЗИРОВАНИЯ УСТОЙЧИВОСТИ К ПИРАЗИНАМИДУ ВОЗБУДИТЕЛЯ ТУБЕРКУЛЁЗА

Аннотация:

Пиразинамид играет важную роль в терапии туберкулёза. Однако микробиологический тест на пиразинамид более сложен и менее надежен, чем тест на другие противотуберкулёзные препараты, из-за необходимости выращивания возбудителя при pH 5.5. Выявление мутаций, вызывающих устойчивость к противотуберкулёзным препаратам, может заменить микробиологические методы. Мутации в генерпсА определяют основной механизм устойчивости к пиразинамиду и обнаруживаются более чем в 90% устойчивых штаммов. Однако генетический метод определения чувствительности к лекарственным препаратам весьма сложен, поскольку мутации, приводящие к резистентности пиразинамиду, разнообразны и рассеяны по всему гену. Разработан пакет программ для автоматической интерпретации данных и прогнозирования устойчивости к пиразинамиду по результатам секвенирования по Сэнгеру. Проведено сравнительное исследование эффективности выявления резистентности к пиразинамиду на 16 клинических образцах с использованием автоматизированной системы ВАСТЕС MGIT 960 и секвенирования гена рпсА по Сэнгеру с автоматизированным анализом результатов. Показано значимое преимущество разработанного метода перед микробиологическим при однократном исследовании, обусловленное большей надёжностью получения результатов независимо от чистоты полученных изолятов.

Авторы:

Издание: Бюллетень экспериментальной биологии и медицины
Год издания: 2022
Объем: 5с.
Дополнительная информация: 2022.-N 11.-С.580-584. Библ. 15 назв.
Просмотров: 14