Выявление потенциальных биомаркеров воспалительных заболеваний кишечника с помощью нецелевой метаболомики сыворотки крови

Аннотация:

Цель. Выявление потенциальных биомаркеров воспалительных заболеваний кишечника с помощью нецелевой метаболомики сыворотки крови у пациентов с язвенным колитом. Пациенты и методы. В пилотное исследование было включено 9 пациентов с активным язвенным колитом и 11 условно здоровых добровольцев мужского пола. Метаболомный анализ сыворотки крови был проведен методом газовой хроматографии-масс-спектрометрии. Идентификацию соединений проводили с помощью библиотеки масс-спектров NIST08. Классификацию образцов и поиск потенциальных биомаркеров проводили с помощью метода опорных векторов (SVM), дискриминантного анализа проекций на латентные структуры (PLS-DA) и наивного байесовского классификатора (Naive Bayes). При выборе классификатора руководствовались значениями площади под ROC-кривой. Результаты. В результате метаболомного анализа сыворотки крови было выявлено 85 соединений, из которых аннотировано 79 соединений. Нормированные уровни 14 метаболитов (2-гидроксимасляная кислота, каприловая кислота, эритроновая кислота, креатинин, p-глицерофосфат, а-глицерофосфат, 2-кето-D-глюконовая кислота, пентадекановая кислота, транс-пальмитолеиновая кислота, пальмитиновая кислота, маргариновая кислота, пальмитолеиновая кислота, сквален, а-токоферол) значимо различались между группами. Сывороточный уровень этих соединений (кроме а-токоферола) у пациентов с язвенным колитом был повышен по сравнению со здоровыми добровольцами, что сопровождалось увеличением разброса концентраций. Наибольшая площадь под ROC-кривой при классификации соответствовала классификатору Naive Bayes (AUG = 0,931; превосходное качество модели). Заключение. Исследование выявило 14 метаболитов, которые при надлежащей верификации могут быть использованы в качестве биомаркеров воспалительных заболеваний кишечника, как в диагностических целях, так и для контроля эффективности терапии. Выявление метаболитов, значимо связанных с патогенезом или саногенезом заболевания, будет способствовать созданию принципиально новых биотерапевтических препаратов.

Авторы:

Издание: Вопросы детской диетологии
Год издания: 2022
Объем: 12с.
Дополнительная информация: 2022.-N 6.-С.21-32. Библ. 64 назв.
Просмотров: 16