ОТЛИЧИЯ В ТРАНСКРИПТОМНЫХ ПРОФИЛЯХ ОПУХОЛЕЙ ГОЛОВНОГО МОЗГА и щитовидной ЖЕЛЕЗЫ С ПЕРЕСТРОЙКОЙ ГЕНОВ NTRK

Аннотация:

Известно, что при наличии химерных генов NTRKвозможно назначение энтректиниба и ларотректиниба вне зависимости от локализации опухоли. В данной работе проведено сравнение изменений транскрипционной активности генов в опухолях головного мозга (ОГМ) и рака щитовидной железы (РЩЖ) с перестройкой генов NTRK(NTRK+) и без неё (NTRK-) с использованием баз данных The Cancer Genome Atlas (TCGA) и Gene Expression Omnibus (GEO). Выявлено увеличение уровня транскрипции гена JUN в образцах NTRK+ по сравнению с образцами NTRK-: в 1.6 раза для OEM ( =0.239) и в 2.5 раза для РЩЖ (р=0.003), а также повышение уровня транскрипции восьми HОХ-генов (в 85-725 раз; <0.05) в образцах ОГМ NTRK+ по сравнению с NTRK-. В образцах РЩЖ NTRK+ количество miR-31 и miR-542 было значимо выше в 3 и 2.5 раза, чем в образцах NTRK-. Для образцов ОГМ NTRK+ количество miR-10b, miR-182 и miR-21 было более чем в 5 раз больше по сравнению с образцами NTRK- (р<0.05). Полученные нами данные отражают отличия в активации транскрипции генов в результате перестройки генов NTRK в ОГМ и РЩЖ.

Авторы:

Издание: Бюллетень экспериментальной биологии и медицины
Год издания: 2023
Объем: 9с.
Дополнительная информация: 2023.-N 1.-С.91-99. Библ. 15 назв.
Просмотров: 24