ВЫЯВЛЕНИЕ ХИМЕРНЫХ ГЕНОВ NTRK3 В КЛЕТКАХ ПАПИЛЛЯРНОГО РАКА ЩИТОВИДНОЙ ЖЕЛЕЗЫ С ПОМОЩЬЮ АНАЛИЗА ДИСБАЛАНСА ЭКСПРЕССИИ 5 И 3 ФРАГМЕНТОВ мРНК

Аннотация:

Стандартом выявления химерных генов нейротрофических рецепторных тирозинкиназ (NTRK) является массовое параллельное секвенирование (NGS), однако это дорогостоящий анализ, для выполнения которого требуется несколько дней, В качестве быстрого скринингового метода для выявления NТRKЗ-зависимого папиллярного рака щитовидной железы использовали анализ дисбаланса экспрессии 5'- и 3'- фрагментов мРНК NTRK3. Референсным методом определения перестроек NTRK3 служила флюоресцентная гибридизация in situ (FISH), а для наиболее частых типов перестроек при папиллярном раке щитовидной железы— ПЦР с обратной транскрипцией (RT-PCR). С помощью 573' RT-PCR выявлено 18 образцов папиллярного рака щитовидной железы, несущих химерные транскрипты мРНК NTRK3. Чувствительность разработанной методики составила 88.9%, специфичность — 99.3%. Предложен быстрый и экономичный метод предскрининга образцов папиллярного рака щитовидной железы в парафиновых блоках с приемлемой чувствительностью и специфичностью.

Авторы:

Издание: Бюллетень экспериментальной биологии и медицины
Год издания: 2023
Объем: 7с.
Дополнительная информация: 2023.-N 2.-С.203-209. Библ. 15 назв.
Просмотров: 19