ПАНЕЛЬ ПРАЙМЕРОВ ДЛЯ ОЦЕНКИ ГЕНОВ АНТИБИОТИКОРЕЗИСТЕНТНОСТИ С ДЕТЕКЦИЕЙ РЕЗУЛЬТАТОВ В ФОРМАТЕ РЕАЛЬНОГО ВРЕМЕНИ

Аннотация:

Все большее значение приобретает проблема распространения aнтибиотикорезистентности среди возбудителей нозокомиальных инфекций. С целью совершенствования микробиологического мониторинга целесообразно применение методов, позволяющих быстро определять наибольшее количество детерминант антибиотикорезистентности. В связи с этим представляется актуальной разработка ПЦР тест-систем для детекции генов антибиотикорезистентности, в частности, для скрининга госпитализируемых пациентов и выявления случаев внутрибольничного заражения. Цель. Разработать панель праймеров для детекции генов антибиотикорезистентности с помощью ПЦР с визуализацией результатов в режиме реального времени. Материалы и методы. Для дизайна специфичных праймеров и зондов использовались референсные последовательности из баз данных Национального центра биотехнологической информации (NCBI). Подбор праймеров и оценку специфичности осуществляли при помощи программ NCBT PrimerBlast и Рrimеr3. Тестирование праймеров для ПЦР-амплификации ряда генов антибиотикорезистентности проводилось на штаммах Klebsiella pneumoniae. Данные штаммы были выделены из клинического материала реанимационных пациентов с COVID-19, и проведено полногеномное секвенирование штаммов с детальной оценкой резистома, вирулома. Осуществлено сравнение результатов полногеномного секвенирования и мультиплексной real-time ПЦР. Результаты. Нами разработан набор праймеров для детекции генов антибиотикорезистентности, в том числе карбапенемаз, с помощью мультиплексной ПЦР в режиме реального времени. Заключение. Разрабатанная панель праймеров может быть использована для скрининга изолятов Klebsiella pneumoniae на наличие генов резистентности, в дальнейшем требуется расширение спектра детектируемых генов и апробация панели на клиническом материале.

Авторы:

Издание: Российский журнал персонализированной медицины
Год издания: 2023
Объем: 8с.
Дополнительная информация: 2023.-N 1.-С.72-79. Библ. 18 назв.
Просмотров: 16