ОПТИМИЗАЦИЯ СТРУКТУРЫ а-ГАРПИНИНА, БЛОКИРУЮЩЕГО КАЛИЕВЫЕ КАНАЛЫ Кv1.3

Аннотация:

Актуальной задачей современной физиологии и фармакологии является получение соединений, обладающих специфичностью в отношении определенных изоформ ионных каналов. В серии статей мы показали, что а-гарпининовая укладка может служить шаблоном для рационального проектирования пептидных лигандов калиевых каналов. В данной работе было использовано молекулярное моделирование, чтобы оптимизировать структуру ранее полученного пептида Tk-hefu-10, селективного блокатора каналов Kv1.3, полумаксимальная концентрация ингибирования (ИК50) для которого составляет ~ 150 нМ. Расчеты молекулярной динамики комплекса Tk-hefu-10—Kv1.3 предоставили информацию о взаимодействии отдельных аминокислотных остатков пептида и канала, а анализ этих взаимодействий позволил предложить аминокислотные замены в структуре Tk-hefu-10 для увеличения его аффинности. Новый пептид Tk-hefu-12 представляет собой укороченный на один остаток аналог Tk-hefu-10 с пятью заменами; экспериментальная проверка активности показала, что его ИК50 ~ 70 нМ против Kv1.3. Кроме того, в структуре Tk-hefu-12 отсутствуют остатки метионина, что позволяет перейти к получению пептидов линейки Tk-hefu с использованием бромциана.

Авторы:

Издание: Российский физиологический журнал
Год издания: 2023
Объем: 11с.
Дополнительная информация: 2023.-N 1.-С.108-118. Библ. 26 назв.
Просмотров: 14