ОСОБЕННОСТИ КОМПЛЕКСОВ САМООРГАНИЗУЮЩИХСЯ ПЕПТИДОВ H-(RADA)4-OH СО СЛОЯМИ В syn- И anti-ОРИЕНТАЦИИ

Аннотация:

Молекулы пептида H-(RADA)4-OH в водно-солевых растворах способны образовывать двуслойные фибриллы в виде биотропного материала, который пригоден в качестве подложки для роста и дифференцировки клеток позвоночных. В филаменте два В-слоя взаимодействуют гидрофобными поверхностями, сформированными метильными группами остатков аланина. Заряженные группы остатков аргинина и аспарагиновой кислоты экспонированы вовне, при этом пептиды, слагающие филамент, находятся в В-конформации. Методом молекулярной динамики изучали изменения во времени геометрии комплексов 24 пептидов H-(RADA)4-OH при 80 и 300 К. Определено, что комплекс антипараллельных пептидов наиболее стабилен, характеризуется наименьшими величинами свободной энергии и среднеквадратичного отклонения координат атомов (RMS) при 80 и 300 К. Впервые охарактеризована модель стабильной структуры комплекса 24 параллельных пептидов, состоящего из двух В-слоев в syn-ориентации. Наличие нескольких стабильных комплексов пептидов, имеющих разную компоновку молекул H-(RADA)4-OH в составе протофиламента, подчеркивает важность изучения способов самоорганизации пептидов в растворе.

Авторы:

Издание: Биоорганическая химия
Год издания: 2023
Объем: 13с.
Дополнительная информация: 2023.-N 3.-С.306-318. Библ. 30 назв.
Просмотров: 19