ВОЗМОЖНОСТИ КОМПЛЕКСНОГО АНАЛИЗА ДАННЫХ СЕКВЕНИРОВАНИЯ РНК ЕДИНИЧНЫХ КЛЕТОК. Обзор

Аннотация:

Секвенирование РНК единичных (отдельных/индивидуальных) клеток (single-cell RNA-sequencing, scRNA-seq) является революционным инструментом для изучения физиологии нормальных и патологически изменённых тканей. Данный подход предоставляет информацию о молекулярных особенностях (генной экспрессии, мутациях, степени открытости хроматина и др.) клеток, открывает возможность для анализа траекторий клеточной дифференцировки/филогении и межклеточных взаимодействий и позволяет обнаруживать новые типы клеток и ранее неизученные процессы. В клиническом аспекте scRNA-seq позволяет проводить более глубокий и детальный анализ молекулярных механизмов развития различных заболеваний и предоставляет основу для разработки новых профилактических, Диагностических и терапевтических решений. В данном обзоре описываются различные подходы к анализу данных scRNA-seq, рассматриваются сильные стороны и недостатки биоинформатических инструментов, приводятся рекомендации и примеры их успешного использования и предлагаются потенциальные направления в области их совершенствования. Также подчёркивается необходимость создания новых, в том числе мультиомиксных, протоколов для подготовки библиотек единичных клеток с целью получения более полного и системного представления о каждой клетке.

Авторы:

Издание: Биохимия
Год издания: 2023
Объем: 28с.
Дополнительная информация: 2023.-N 2.-С.171-198. Библ. 150 назв.
Просмотров: 24