Разнообразие CRISPR-локусов штаммов Yersinia pseudotuberculosis и их ассоциация с факторами патогенности возбудителя

Аннотация:

Постоянный обмен наследственной информацией с участием внехромосомных и транспозируемых элементов является одним из факторов существования гетерогенных популяций микроорганизмов. Структуры, контролирующие горизонтальный перенос генов, могут влиять на формирование генетических вариантов патогенов. Цель работы — изучить молекулярно-генетические характеристики CRISPR-локусов штаммов Yersinia pseudotuberculosis, циркулирующих на территории России, и их связь с факторами патогенности возбудителя псевдотуберкулёза. Материалы и методы. В работе изучены 56 штаммов Y. pseudotuberculosis, выделенных в течение 1935—2014 гг. на различных территориях России и других государств из разных источников. Выделение и амплификацию фрагментов ДНК, содержащих CRISPR-локусы, выполняли методом полимеразной цепной реакции. Секвенирование CRISPR-локусов осуществляли по методу Сэнгера. Для каждого штамма определён генотип по наличию основных факторов патогенности: хромосомных генов суперантигена уртА/С, генов, локализованных на «островах патогенности» HPI, YAPI, генов плазмиды pYV, pVM82. Результаты. В результате анализа CRISPR-локусов штаммов Y. pseudotuberculosis установлено, что спейсерный состав локусов различается у штаммов, отличающихся серотипом, набором факторов патогенности, регионом выделения. Наиболее вариабельны локусы YP1 и YP3, локус YP2 однороден. Состав локуса YP1 различается в группах штаммов, отличающихся по наличию плазмиды pVM82. Состав локуса YP3 зависит и от наличия плазмиды pVM82, и от «адгезивного острова патогенности» YAPI. Заключение. На территории России циркулируют штаммы Y. pseudotuberculosis с различным набором детерминант вирулентности и спейсерным составом CRISPR-локусов. Большинство российских штаммов отличаются по данным молекулярным маркерам от штаммов из других стран. Высокая вариабельность штаммов внутри вида определяется способностью приобретать новые генетические элементы путём горизонтального переноса генов. CRISPR-Cas как система «иммунитета» бактерий против мобильных генетических элементов может участвовать в формировании патогенного потенциала штаммов Y. pseudotuberculosis.

Авторы:

Издание: Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии
Год издания: 2023
Объем: 10с.
Дополнительная информация: 2023.-N 3.-С.166-175. Библ. 33 назв.
Просмотров: 17