Геномная характеристика mecA-положительных Staphylococcus aureus ST59, проявляющих чувствительность к оксациллину

Аннотация:

Цель. Провести геномную характеристику представителей mecA-положительных оксациллиночувствительных Staphylococcus aureus ST59, выделенных в Санкт-Петербурге. Материалы и методы. B работу включены девять mecA-положительных оксациллиночувствительных изолятов S. aureus (OS-MRSA), относящихся к сиквенс-типу ST59. Изоляты были выделены в Санкт-Петербурге в 2018-2019 гг. у детей без признаков стафилококковых инфекций при скрининге на носительство S. aureus. Один изолят был выделен у взрослого пациента с инфекцией кожи и мягких тканей (ИКМТ). Проведена оценка чувствительности к антибиотикам и полногеномное секвенирование. Для сравнительной геномной эпидемиологии в работу включены 242 генома S. aureus ST59 из публичных репозиториев. Результаты. Изоляты характеризовались фенотипической чувствительностью к оксациллину, определенной методом серийных разведений и с помощью системы VITEK. Диапазон значений диаметров зон ингибирования вокруг дисков с цефокситином составлял 1 7-Tl мм. Изоляты имели M?K ? 0,5 мкг/мл к пенициллину/клавуланату. S. aureus, выделенные от носителей, имели генотип ST59-t1950-SCCmecVb (seb+); изолят, выделенный при ИКМТ, имел генотип ST59-t437-SCCmecVb (seb/ lukF?l?kS+}. Bce изоляты имели мутации в промоторе mecA в положении -33 (С/Т) и мутации в PBP2a (S225R + E246G). Ha основе филогенетического анализа и Байесовской кластеризации вся выборка геномов ST59 была разделена на четыре кластера; все российские геномы относились к Восточно-Азиатской сублинии ST59, для которой характерно наличие токсина PVL. Попарные сравнения нуклеотидных замен между геномами российских изолятов показали высокую степень идентичности: медиана 13, межквартильный интервал 8 - 1 8 замен. Наличие энтеротоксина В, а также мутаций в промоторных областях гена mecA (-7 G/A или -33 С/Т) и мутаций в PBP2a (S225R и E246G) являлись отличительной особенностью всех кластеров ST59, при этом для российских изолятов была характерна промоторная мутация только в положении -33. Геномы российских изолятов отличались от глобально циркулирующих ST59 уникальными мутациями в следующих локусах (относительно референс-генома S. aureus M013TW): регуляторе катаболизма лактозы RS03495 (N168D); рибосомальном белке L28 (V47A); предположительной глиоксалазе RS07825 (V42A); гипотетическом белке RSI 3235 (K32E). Выводы. Российские изоляты MRSA-ST59 относятся к Восточно-Азиатской сублинии и характеризуются наличием гена энтеротоксина В. Отличительной фенотипической особенностью MRSA-ST59 является чувствительность к оксациллину и пограничная устойчивость к цефокситину. Для OS-MRSA фенотипов существует риск неправильной оценки чувствительности и, как следствие, назначение неадекватной антибактериальной терапии. Выявление гена mecA является наиболее точным методом для дифференциации MSSA и MRSA.

Авторы:

Издание: Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия
Год издания: 2023
Объем: 7с.
Дополнительная информация: 2023.-N 2.-С.116-122. Библ. 24 назв.
Просмотров: 14