Дальневосточный государственный медицинский университет Поиск | Личный кабинет | Авторизация
Поиск статьи по названию
Поиск книги по названию
Каталог рубрик
в коллекциюДобавить в коллекцию

Геномная характеристика mecA-положительных Staphylococcus aureus ST59, проявляющих чувствительность к оксациллину


Аннотация:

Цель. Провести геномную характеристику представителей mecA-положительных оксациллиночувствительных Staphylococcus aureus ST59, выделенных в Санкт-Петербурге. Материалы и методы. B работу включены девять mecA-положительных оксациллиночувствительных изолятов S. aureus (OS-MRSA), относящихся к сиквенс-типу ST59. Изоляты были выделены в Санкт-Петербурге в 2018-2019 гг. у детей без признаков стафилококковых инфекций при скрининге на носительство S. aureus. Один изолят был выделен у взрослого пациента с инфекцией кожи и мягких тканей (ИКМТ). Проведена оценка чувствительности к антибиотикам и полногеномное секвенирование. Для сравнительной геномной эпидемиологии в работу включены 242 генома S. aureus ST59 из публичных репозиториев. Результаты. Изоляты характеризовались фенотипической чувствительностью к оксациллину, определенной методом серийных разведений и с помощью системы VITEK. Диапазон значений диаметров зон ингибирования вокруг дисков с цефокситином составлял 1 7-Tl мм. Изоляты имели M?K ? 0,5 мкг/мл к пенициллину/клавуланату. S. aureus, выделенные от носителей, имели генотип ST59-t1950-SCCmecVb (seb+); изолят, выделенный при ИКМТ, имел генотип ST59-t437-SCCmecVb (seb/ lukF?l?kS+}. Bce изоляты имели мутации в промоторе mecA в положении -33 (С/Т) и мутации в PBP2a (S225R + E246G). Ha основе филогенетического анализа и Байесовской кластеризации вся выборка геномов ST59 была разделена на четыре кластера; все российские геномы относились к Восточно-Азиатской сублинии ST59, для которой характерно наличие токсина PVL. Попарные сравнения нуклеотидных замен между геномами российских изолятов показали высокую степень идентичности: медиана 13, межквартильный интервал 8 - 1 8 замен. Наличие энтеротоксина В, а также мутаций в промоторных областях гена mecA (-7 G/A или -33 С/Т) и мутаций в PBP2a (S225R и E246G) являлись отличительной особенностью всех кластеров ST59, при этом для российских изолятов была характерна промоторная мутация только в положении -33. Геномы российских изолятов отличались от глобально циркулирующих ST59 уникальными мутациями в следующих локусах (относительно референс-генома S. aureus M013TW): регуляторе катаболизма лактозы RS03495 (N168D); рибосомальном белке L28 (V47A); предположительной глиоксалазе RS07825 (V42A); гипотетическом белке RSI 3235 (K32E). Выводы. Российские изоляты MRSA-ST59 относятся к Восточно-Азиатской сублинии и характеризуются наличием гена энтеротоксина В. Отличительной фенотипической особенностью MRSA-ST59 является чувствительность к оксациллину и пограничная устойчивость к цефокситину. Для OS-MRSA фенотипов существует риск неправильной оценки чувствительности и, как следствие, назначение неадекватной антибактериальной терапии. Выявление гена mecA является наиболее точным методом для дифференциации MSSA и MRSA.

Авторы:

Гостев В.В.
Сулян О.С.
Павлова П.А.
Нестерова Е.В.
Калиногорская О.С.
Чулкова П.С.
Трофимова Н.Н.
Агеевец В.А.
Агеевец И.В.
Сидоренко С.В.

Издание: Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия
Год издания: 2023
Объем: 7с.
Дополнительная информация: 2023.-N 2.-С.116-122. Библ. 24 назв.
Просмотров: 14

Рубрики
Ключевые слова
aureus
l2
mrsa
st
staphylococcus
анализ
антибактериальные
антибиотик
байесовские
бактериальный
бактерий
белковая
взрослые
включениями
восточный
вспомогательная
выборка
вывод
выделение
высокий
выявление
гена
генетическая
геном
генотип
глиоксаль
глобального
детей
диапазона
дифференциация
замена
значению
зоны
идентичности
изоляты
ингибирование
интервал
инфекцией
исследования
катаболизм
клавуланата
кластер
кластеризация
ключ
кожи
лактоза
лекарственная
локус
материал
медиана
метод
методы
модификация
мутации
мягкая
назначение
наличия
неадекватный
неправильно
носители
нуклеотидный
областей
оксациллин
определенного
основа
особенности
отличия
относительная
оценка
пациент
пенициллин
пограничная
полногеномная
положение
помощи
представители
признаки
проведения
промотора
проявления
публичный
работа
разведения
разделение
регуляторы
результата
рибосомальный
риск
российская
российские
секвенирование
серийное
систем
скрининг
след
следствия
слова
состав
сравнение
сравнительная
средства
стафилококковая
степени
терапия
ткань
токсин
точная
устойчивости
устойчивость
фенотип
фенотипические
филогенетический
характер
характеристика
характерного
химиотерапия
цель
цефокситин
циркулирующие
четыре
чувствительность
энтеротоксин
эпидемиологические
эпидемиология
Ваш уровень доступа: Посетитель (IP-адрес: 18.97.14.86)
Яндекс.Метрика