ДНК-транспозоны pogo в геномах медуз рода Aurelia

Аннотация:

Цель исследования. Мобильные генетические элементы (МГЭ) — последовательности ДНК, способные к перемещениям внутри генома хозяина. В результате постоянно идущих мутационных процессов и слабого давления естественного отбора эволюционное разнообразие МГЭ постоянно возрастает. ДНК-транспозоны эукариот представляют собой очень многочисленную и разнообразную группу МГЭ. Данная работа направлена на изучение ДНК-транспозонов pogo в трех геномах медуз рода Aurelia: Aurelia aurita, Aurelia coerulea, Aurelia aurita complex sp. Материал и методы. В данной работе для поиска МГЭ группы pogo был использован метод локального выравнивания (BLASTn). Множественное выравнивание аминокислотных последовательностей было выполнено с помощью MAFFT. Результаты и обсуждение. Показано, что большинство pogo-элементов представлено элементами Fot/Fot-like семейства. В этой группе определено два новых подсемейства — auFLEI и auFLE2. Также у медуз была выявлена группа Jelly, включающая два элемента. Среди обнаруженных элементов pogo не было найдено потенциально-функциональных ДНК-транспозонов. Заключение. Анализ выявленных pogo-элементов показал, что активные ДНК-транспозоны в изученных нами геномах медуз не сохранились: все элементы повреждены мутациями или имеют делеции и не представлены полноразмерными копиями. Это позволило предположить, что пик активности данных транспозонов был относительно давно.

Авторы:

Издание: Молекулярная генетика ,микробиология и вирусология
Год издания: 2023
Объем: 7с.
Дополнительная информация: 2023.-N 2.-С.21-27. Библ. 30 назв.
Просмотров: 14