Генетическая вариабельность риккетсий в клещах Dermacentor spp. на территории Западной Сибири и Северного Казахстана

Аннотация:

Цель исследования. Изучить распространение, видовое разнообразие и генетическую вариабельность риккетсий в клещах Dermacentor spp. на территории Западной Сибири и Северного Казахстана. Образцы от 571 клеша рода Dermacentor (406 Dermacentor reticulatus, 136 Dermacentor nuttalli, 21 Dermacentor marginatus и 8 Dermacentor silvarum} были исследованы на наличие ДНК Rickettsia spp. методом двухраундовой ПЦР. Видовая принадлежность риккетсий была установлена методом видоспецифичной ПЦР и/или секвенированием фрагментов gltA гена. Для ряда образцов Rickettsia raoultii были дополнительно определены нуклеотидные последовательности фрагментов генов отрА (3266 н.п.) и отрВ (4852 н.п.). В результате в исследованных клещах обнаружена ДНК четырех видов риккетсий, а также нового генотипа Rickettsia spp. Ко-97-Dr, не относящегося к известным видам. Все виды клещей наиболее часто были инфицированы R. raoultii; уровень инфицированности варьировал от 47,0 до 86,8%. ДНК Rickettsia sibirica была обнаружена в 16,1—45,7% О. nuttalli на трех участках Республики Алтай. ДНК Rickettsia aeschlimannii, Rickettsia aeschlimannil-like, «Candidates Rickettsia tarasevichiae» и новый генотип Rickettsia sp. Ко-97-Dr были обнаружены в единичных D. reticulatus и D. marginatus. На основании анализа фрагмента гена gltA было идентифицировано семь сиквенс-вариантов R. raoultii, четыре из которых соответствовали ранее описанным генотипам данного вида. Проведенный анализ образцов R. raoultii по протяженным фрагментам отрА и отрВ показал наличие трех генетических групп, соответствующих различным генотипам по гену gltA. Заключение. В клешах Dermacentor spp. были обнаружены как типичные, так и нетипичные для данных клешей виды риккетсий. Показано существование природных очагов сибирского клещевого тифа на территории Республики Алтай. На основании анализа вариабельных генов поверхностных белков и консервативного гена gltA показано существование трех генетических групп R. raoultii.

Авторы:

Издание: Молекулярная генетика ,микробиология и вирусология
Год издания: 2023
Объем: 10с.
Дополнительная информация: 2023.-N 3.-С.25-34. Библ. 30 назв.
Просмотров: 13