ВИДОВАЯ ИДЕНТИФИКАЦИЯ КОРОНАВИРУСА SARS-CoV-2 ПО КОНСЕРВАТИВНОМУ УЧАСТКУ Е-ГЕНА

Аннотация:

Появление мутаций в генах, кодирующих поверхностные белки коронавируса нового типа SARSCoV-2, при его циркуляции в популяции хозяина затрудняет применение моноклональных антител для видовой идентификации данного вируса. В таких случаях выбор консервативных генетических мишеней позволяет осуществлять идентификацию молекулярно-биологическими методами. В настоящей работе проведено тестирование разработанных ранее праймеров, специфичных к фрагменту Е-гена, для выявления коронавируса нового типа на шести изолятах, принадлежащих различным генетическим вариантам SARS-CoV-2 (исходный уханьский геновариант, дельта и омикрон). Выбор консервативного участка Е-гена (Е gene, кодирующий малый трансмембранный белок Е) в качестве мишени для обратной транскрипции с последующей амплификацией (ОТ-ПЦР) позволил детектировать коронавирус SARS-CoV-2 вне зависимости от его генетических вариантов, характеризующихся антигенной разнородностью по N- и S-белкам. Показана возможность видового определения различных вариантов возбудителя COVID-19, циркулирующих в России, как в общем реакционном объеме (в пробирке), так и на биологических микрочипах (гелевых и щеточных).

Авторы:

Издание: Биоорганическая химия
Год издания: 2023
Объем: 5с.
Дополнительная информация: 2023.-N 5.-С.543-547. Библ. 8 назв.
Просмотров: 20