АЛЬТЕРНАТИВНЫЕ ЦЕНТРЫ СВЯЗЫВАНИЯ ХРОМОФОРА В НЕКОВАЛЕНТНЫХ ФЛУОРЕСЦЕНТНЫХ КОМПЛЕКСАХ БАКТЕРИАЛЬНОГО ЛИПОКАЛИНА

Аннотация:

Природные липокалины представляют собой семейство небольших белков, встречающихся в различных биологических системах. Они имеют общую бета-структурную укладку и обладают способностью к комплексообразованию малых молекул для различных физиологических целей. Охарактеризовано более десяти различных изотипов липокалина с разной специфичностью к лиганду и физиологической функцией. Биомаркеры группы DiB1—3 получены на основе нековалентных комплексов генно-инженерных вариантов В1с (в качестве флуороген-активирующего белка, ~20 кДа) с синтетическим GFP-пoдобным хромофором М739. Флуороген М739 демонстрирует быстрое проникновение в клетку и обратимое мечение, что позволяет легко настраивать плотность мечения в живых клетках по требованию. Это значительно упрощает окрашивание клеток, позволяя проводить более сложные эксперименты. В принципе, в одном эксперименте можно комбинировать различные системы мечения с временным разделением на основе флуорогена. Липокалин В1с, использованный для связывания различных малых молекул, оказался многообещающим каркасом для создания систем маркировки на основе флуорогена. Полученные комплексы демонстрируют яркую флуоресценцию и существенно более высокую фотостабильность, чем коммерческие биомаркеры mKate и EGFP, и представляют собой первые примеры дизайна новых флуоресцентных биомаркеров с использованием липокалина. Цель данной работы — установление пространственной организации флуоресцентного нековалентного комплекса DiB3 расчетным методом молекулярной механики и сопоставление полученной расчетной модели DiB3 с кристаллической структурой родственного комплекса DiB1.

Авторы:

Издание: Биоорганическая химия
Год издания: 2023
Объем: 5с.
Дополнительная информация: 2023.-N 5.-С.548-552. Библ. 13 назв.
Просмотров: 19