ПРОТЕОМНЫЙ ПОДХОД ДЛЯ ИССЛЕДОВАНИЯ ЭКСПРЕССИИ, ЛОКАЛИЗАЦИИ И ФУНКЦИЙ БЕЛКОВОГО ПРОДУКТА ГЕНА SOWAHD В ПРОЦЕССЕ ГРАНУЛОЦИТАРНОЙ ДИФФЕРЕНЦИРОВКИ

Аннотация:

Каталогизация белков человека, определение уровня их содержания, клеточной локализации, выполняемой функции и потенциальной медицинской значимости являются важными задачами, стоящими перед мировым протеомным сообществом. В настоящее время локализация и функции белковых продуктов для почти половины белок-кодирующих генов неизвестны или слабо изучены. Исследование протеома органелл является многообещающим подходом для выявления локализации и функций белков человека. Протеом клеточного ядра представляет особый интерес, поскольку многие белки с ядерной локализацией, например, транскрипционные факторы, выполняют регуляторные функции, определяющие судьбу клеток. По результатам метаанализа ядерного протеома, или нуклеома, клеток линии HL-60 под действием полностью-транс-ретиноевой кислоты (ATRA) выявили, что функция и локализация белкового продукта гена SOWAHD слабо изучена, кроме того, отсутствует исчерпывающая информация об экспрессии SOWAHD на уровне белка. В клетках линии HL-60 для белок-кодирующего гена SOWAHD определили экспрессию мРНК на уровне 6,4 ± 0,7 транскриптов на миллион молекул. С помощью направленной масс-спектрометрии измерили содержание белка SOWAHD (белок 58, содержащий домен анкириновых повторов) в диапазоне 0,27—1,25 фмоль/мкг общего белка. С применением пульсового мечения стабильными изотопами определили, что время полураспада для белкового продукта гена SOWAHD составляет приблизительно 19 ч. Протеомное профилирование ядерной фракции клеток линии HL-60 показало, что содержание белка SOWAHD увеличивалось в процессе ATRA-индуцированной гранулоцитарной дифференцировки, с пиком в 9 ч после добавления индуктора и с последующим снижением в более поздние временные точки. Результаты исследования впервые указывают на ядерную локализацию и вовлечённость белкового продукта гена SOWAHD в индуцированную гранулоцитарную дифференцировку.

Авторы:

Издание: Биохимия
Год издания: 2023
Объем: 18с.
Дополнительная информация: 2023.-N 10.-С.2014-2031. Библ. 38 назв.
Просмотров: 16