Место эндемичного для республики Caxa (Якутия) генотипа S возбудителя туберкулеза в глобальной филогении по результатам полногеномного секвенирования

Аннотация:

Цель исследования: оценить устойчивость циркуляции генотипа S и S-подобных штаммов M. tuberculosis (МБТ) на территории Республики Caxa (Якутия) за 12-летний период и провести их филогенетическую идентификацию относительно Евро-Американской сублинии L4.4. Материалы и методы. B период с 2009 по 2022 гг. молекулярно-генетическими методами исследовано 513 штаммов МБТ от больных туберкулезом легких. Обнаружено 92 изолята, принадлежащих генотипу S или имевшему S-подобный генетический профиль. Проведено полногеномное секвенирование пяти штаммов генотипа S, циркулировавших на территории PC (Я) в 2020-2022 гт. Выполнен глобальный филогенетический анализ и определены эволюционные взаимоотношения полученных геномов, разработан ПЦР-РВ тест для экспресс-выявления штаммов генотипа S. Результаты. Наблюдается устойчивая циркуляция МБТ S и S-подобных генотипов на территории PC (Я), принадлежащих Евро-Американской сублинии L4.4, подтип L4.4.1.1. Эволюционная модель подтвердила ранее высказанную нами гипотезу о том, что распространение генотипа S среди коренного населения Якутии связано с массовыми контактами с русскими переселенцами, начиная с 17 века. Заключение. Распространение штаммов МБТ Евро-Американской сублинии L4.4, подтип L4.4.1.1 среди коренного населения Новой Зеландии, Канады и Якутии в 17-19 веках имеет большое сходство.

Авторы:

Издание: Туберкулез и болезни легких
Год издания: 2023
Объем: 6с.
Дополнительная информация: 2023.-N 5.-С.14-19. Библ. 19 назв.
Просмотров: 12