Анализ плазмид комплекса Klebsiella pneumoniae, несущих кластер генов синтеза аэробактина, представленных в международных базах данных

Аннотация:

На данный момент принято выделять два патотипа Klebsiella pneumoniae — классические и гипервирулентные, обладающие способностью вызывать внебольничные инфекции у здоровых людей. Показано, что увеличение вирулентности связано с приобретением дополнительного генетического материала — плазмиды, несущей кластер генов аэробактина. Цель. Оценить распространённость данных вирулентных плазмид в мире и в России и выявить ключевые генетические особенности. Материал и методы. Последовательности плазмид были выгружены из баз данных PLSDB и BV-BRC, аннотированы программами Abricate и Kleborate, кластерный анализ проведён программой mge-cluster, филогенетический анализ программой Parsnp. Результаты. Было проанализировано 296 последовательностей плазмид, выделенных из 23 стран из клинических изолятов К.рnеumoniae в период с 2006 г. по 2021 г. с пиковым значением в 2019 г., более половины плазмид — из Китая. Было идентифицировано более 30 сиквенс типов, среди которых преобладали ST11 и ST23. Гены репликонов группы IncFIB были выявлены почти во всех исследуемых плазмидах. Преобладающим типом аэробактина в исследуемых последовательностях был первый, также были выявлены последовательности с iuc3 и iuc5. Гены синтеза сальмохелина были выявлены только в 37,1% последовательностей, кластер йерсиниабактина был идентифицирован на двух плазмидах из Китая. 32,1% плазмид несли гены устойчивости, из которых 7,4% — гены бета-лактамаз расширенного спектра и в 5% были выявлены гены карбапенемаз. Было получено 9 кластеров последовательностей, почти все плазмиды из России были отнесены к одному кластеру и были NDM-позитивными. Вместе с плазмидами из других европейских стран (Великобритания, Норвегия, Чехия) они образовали отдельную ветку на филогенетическом дереве. Заключение. Вирулентные плазмиды, несущие кластер генов синтеза аэробактина, имеют глобальное распространение, почти треть из них несут также гены устойчивости к антибиотикам.

Авторы:

Издание: Антибиотики и химиотерапия
Год издания: 2023
Объем: 10с.
Дополнительная информация: 2023.-N 7-8.-С.17-26. Библ. 43 назв.
Просмотров: 12