ТОПОЛОГИЯ ПОЛИУБИКВИТИНОВЫХ ЦЕПЕЙ В ХРОМАТОСОМНОМ ОКРУЖЕНИИ УБИКВИТИН-ЛИГАЗЫ Е3 RNF168

Аннотация:

Убиквитин-лигаза Е3 RNF168 суперсемейства RING является важнейшим компонентом комплекса, осуществляющего убиквитинирование гистонов Н2А/Н2АХ вблизи двуцепочечных разрывов ДНК, что является ключевой стадией привлечения факторов репарации к месту повреждения. В настоящей работе нами однозначно показано, что RNF168 не имеет природной способности непосредственно различать архитектуру полиубиквитиновых цепей, за исключением тропности двух её убиквитин-связывающих доменов UDM1/2 к убиквитинам, соединённым через аминокислотный остаток К63. Анализ внутриклеточного хроматосомного окружения полноразмерной RNF168 и её доменов методом лиганд-индуцированного резонансного переноса биолюминесценции выявил, что С-концевая часть UDM1 ассоциирована с К63-полиубиквитиновыми цепями; RING и А-концевая часть UDM2 стерически сближены с К63- и К48-убиквитиновыми цепями, в то время как С-концевая часть UDM1 колокализована со всеми возможными вариантами убиквитина. Полученные результаты совместно с имеющимися структурными данными позволяют выдвинуть гипотезу, что С-концевая часть UDM1 связывает К63-полиубиквитиновые цепи на линкерном гистоне H1; RING и А-концевая часть UDM2 находятся в центральной части нуклеосомы и сближены с Н1 и К48-убиквитинированными альтернативными субстратами RNF168, возможно, деметилазами JMJD2A/B, в то время как С-концевая часть UDM1, вероятно, находится в области активированного остатка убиквитина, связанного с убиквитин-лигазой Е2 в составе комплекса с RNF168. Резюмируя, наши данные могут объяснить наличие большого количества протяжённых неструктурированных участков в RNF168, которые потенциально необходимы этой Е3-лигазе для корректного позиционирования доменов UDM1/2 с целью многоточечного взаимодействия со множеством партнёров в её динамическом хроматосомном окружении.

Авторы:

Издание: Биохимия
Год издания: 2023
Объем: 11с.
Дополнительная информация: 2023.-N 12.-С.2446-2456. Библ. 31 назв.
Просмотров: 14