ИЗМЕНЕНИЯ В СТРУКТУРЕ ВИРИОНА А-ВИРУСА КАРТОФЕЛЯ ПРИ ОГРАНИЧЕННОМ ПРОТЕОЛИЗЕ in situ ПО ДАННЫМ ТРИТИЕВОГО МЕЧЕНИЯ И КОМПЬЮТЕРНОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ

Аннотация:

Белки оболочки (БО) вирионов потивируса A-вируса картофеля (АВК) содержат на поверхности частично неупорядоченные N-концевые домены, необходимые для выполнения жизненно важных функций вируса. В данной работе на основе данных, полученных методом тритиевой планиграфии, проведён сравнительный анализ структур БО в интактных вирионах АВК и в частицах вируса, лишённых N-концевых 32 аминокислот (АВКдельта32). С использованием структуры атомного разрешения БО потивируса Y картофеля (YBK), который является гомологом АВК, проведён расчёт доступной поверхности белков вириона YBK и определены области межсубъединичных/межвитковых контактов. Для этого использовали подход, основанный на обкатке сферической пробой поверхности белка, доступной растворителю. Сравнение профилей включения тритиевой метки в интактный и частично деградированный вирион АВКД32 выявило положение дельтаN-пептида, экранирующего остатки 66—73, 141 — 146 и входящие в межвитковую область остатки 161-175. Было обнаружено наличие каналов/полостей в белковой оболочке вириона, благодаря которым он оказался частично проницаемым для атомов трития. При удалении дельтаN-пептида наблюдалось уменьшение содержания метки внутри вириона (в области а.о. 184—200), что указывало на возможный структурный переход, приводящий к компактизации вириона и вследствие этого меньшей доступности для трития его внутренних регионов. На основании полученных данных можно сделать вывод, что часть поверхностного дельтаN-пeптида расположена между витками спирали вириона, это увеличивает шаг спирали и обеспечивает большую гибкость вириону, что важно для межклеточного транспорта вирусов в растениях.

Авторы:

Издание: Биохимия
Год издания: 2023
Объем: 12с.
Дополнительная информация: 2023.-N 12.-С.2541-2552. Библ. 42 назв.
Просмотров: 14