Дальневосточный государственный медицинский университет Поиск | Личный кабинет | Авторизация
Поиск статьи по названию
Поиск книги по названию
Каталог рубрик
в коллекциюДобавить в коллекцию

ИЗМЕНЕНИЯ В СТРУКТУРЕ ВИРИОНА А-ВИРУСА КАРТОФЕЛЯ ПРИ ОГРАНИЧЕННОМ ПРОТЕОЛИЗЕ in situ ПО ДАННЫМ ТРИТИЕВОГО МЕЧЕНИЯ И КОМПЬЮТЕРНОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ


Аннотация:

Белки оболочки (БО) вирионов потивируса A-вируса картофеля (АВК) содержат на поверхности частично неупорядоченные N-концевые домены, необходимые для выполнения жизненно важных функций вируса. В данной работе на основе данных, полученных методом тритиевой планиграфии, проведён сравнительный анализ структур БО в интактных вирионах АВК и в частицах вируса, лишённых N-концевых 32 аминокислот (АВКдельта32). С использованием структуры атомного разрешения БО потивируса Y картофеля (YBK), который является гомологом АВК, проведён расчёт доступной поверхности белков вириона YBK и определены области межсубъединичных/межвитковых контактов. Для этого использовали подход, основанный на обкатке сферической пробой поверхности белка, доступной растворителю. Сравнение профилей включения тритиевой метки в интактный и частично деградированный вирион АВКД32 выявило положение дельтаN-пептида, экранирующего остатки 66—73, 141 — 146 и входящие в межвитковую область остатки 161-175. Было обнаружено наличие каналов/полостей в белковой оболочке вириона, благодаря которым он оказался частично проницаемым для атомов трития. При удалении дельтаN-пептида наблюдалось уменьшение содержания метки внутри вириона (в области а.о. 184—200), что указывало на возможный структурный переход, приводящий к компактизации вириона и вследствие этого меньшей доступности для трития его внутренних регионов. На основании полученных данных можно сделать вывод, что часть поверхностного дельтаN-пeптида расположена между витками спирали вириона, это увеличивает шаг спирали и обеспечивает большую гибкость вириону, что важно для межклеточного транспорта вирусов в растениях.

Авторы:

Ксенофонтов А.Л.
Баратова Л.А.
Семенюк П.И.
Федорова Н.В.
Бадун Г.А.

Издание: Биохимия
Год издания: 2023
Объем: 12с.
Дополнительная информация: 2023.-N 12.-С.2541-2552. Библ. 42 назв.
Просмотров: 14

Рубрики
Ключевые слова
in
situ
аминокислоты
анализ
атом
атомная
белки
белковая
белковый
белок
биохимия
болезни
большая
вирион
вирус
включениями
внутренняя
внутри
вследствие
входной
вывод
выполнение
гибкая
гомология
данные
данных
девиво
дельта
домены
доступ
доступность
жизненно
изменение
интактной
использование
канал
картофель
ключ
компактизация
компьютерная
контакт
межклеточная
метка
метод
мечение
модели
моделирование
наличия
население
необходимые
областей
обнаружение
оболочка
ограниченные
определения
основа
основание
основания
остатки
переход
планиграфия
поверхности
поверхностное
подход
пола
положение
полост
потивирус
приводящей
протеолиза
профиль
работа
разрешение
растворители
растений
растения
регион
сельское
слова
содержание
спирале
сравнение
сравнительная
структур
структурная
сфера
съедобные
транспорт
тритий
удаление
указ
уменьшение
функции
хозяйство
частицы
частичная
часть
шаг
экранов
экспериментальные
Ваш уровень доступа: Посетитель (IP-адрес: 44.192.95.161)
Яндекс.Метрика