АНАЛИЗ ТРАНСКРИПТОМА МОНОЦИТОВ ПЕРИФЕРИЧЕСКОЙ КРОВИ У БОЛЬНЫХ ХРОНИЧЕСКОЙ ОБСТРУКТИВНОЙ БОЛЕЗНЬЮ ЛЕГКИХ

Аннотация:

Известно, что моноциты способны вносить значимый вклад в развитие хронической обструктивной болезни легких (ХОБЛ), однако особенности транскриптома данных клеток, ассоциированные с заболеванием, остаются плохо изученными. Цель. Выполнить анализ транскриптома моноцитов для выявления дифференциально экспрессированных генов и ключевых нарушений биологических процессов в данных клетках при ХОБЛ. В исследование было включено 3 больных ХОБЛ и 3 курильщика без бронхиальной обструкции. Моноциты получали из мононуклеаров периферической крови, проводя обогащение методом адгезии к пластику. Чистота клеток, достигнутая в результате обогащения, по данным проточной цитометрии составила около 90%. Выделенные образцы РНК подвергали очистке от геномной ДНК и рисбосомальной РНК. Секвенирование выполняли на секвенаторе MGISEQ-200 в режиме SE50. Картирование прочтений и подсчет транскриптов выполняли в программном обеспечении Salmon v1. 10.1, дальнейшую обработку данных проводили в программной среде R. В результате анализа в моноцитах больных ХОБЛ было обнаружено 21 апрегулированных и 29 даунрегулированных генов. Среди генов с увеличенной экспрессией наибольшую значимость имели некодирующие РНК PKD1P5-LOC105376752 и PKD1P4-NPIPA8, роль которых остается невыясненной, а также SETDB2, RNASE6, SERPINE1 и MRC1. Даунрегулированные гены, наибольший интерес из которых вызвали F8A2, ZDHHC19, CXCL9, CXCL10, НВА1, НВВ, С2, CFB, CFD, МТ1В, MT1G и TIMP3, продемонстрировали обогащение по 7 категориям генной онтологии (GO), включая категории, связанные с ответом на липополисахариды, пероксид водорода, ионы меди и активацией комплемента. Заключение. Полученные данные указывают на угнетение функциональной активности моноцитов больных ХОБЛ со снижением способности обеспечивать эффективную защиту от микробных патогенов при одновременном ослаблении собственной защиты от активных форм кислорода. Апрегуляция SERPINE1 и даунрегуляция Т1МРЗ могут вносить существенный вклад в ремоделирование дыхательных путей и развитие эмфиземы при ХОБЛ.

Авторы:

Издание: Бюллетень физиологии и патологии дыхания
Год издания: 2023
Объем: 12с.
Дополнительная информация: 2023.-N 90.-С.47-58. Библ. 26 назв.
Просмотров: 15