Исследование резистома микробных сообществ человека с помощью таргетной панели генов антибиотикорезистентности у пациентов с COVID-19

Аннотация:

Цель. Изучение совокупности генов лекарственной устойчивости (резистома) в микробиоме кишечника человека и изменений, проис-ходящих с такими генами на фоне терапии COVID-19 в условиях стационара. Материалы и методы. Проведено одноцентровое ретроспективное когортное исследование. Анализу подлежали только случаи с лабораторно подтвержденной детекцией PHK вируса SARS-CoV-2 с помошью полимеразной цепной реакции в образцах оро-/назофарингеаль-ного мазка. Из обшего списка ретроспективных данных исключены пациенты с документированной (по анамнестическим данным и/или по данным обследования в период госпитализации) органической патологией со стороны гепатобилиарной системы, злокачественными новообразованиями любой локализации, системными и аутоиммунными заболеваниями, а также беременные. V всех участников исследования производился сбор кала для последующего проведения метагеномного секвенирования. Итоговая когорта разделена на 2 группы в зависимости от динамики течения заболевания: легкое течение (группа 1) и тяжелое течение (группа 2). Внутри группы 2 сформированы 5 подгрупп в зависимости от наличия приема антибактериальных препаратов (АБП): группа 2A (с приемом АБП), группа 2AC (прием АБП до госпитализации), группа 2AD (прием АБП во время госпитализации), группа - 2AE (прием АБП во время и до госпитализации), группа 2B (без приема АБП). Результаты. Медиана количества генов антибиотикорезистентности - АБР (кумулятивное во всех временных точках) оказалась достоверно выше в группе пациентов, принимавших АБП: 81,0 (95% доверительный интервал-ДИ 73,8-84,5) против 51,0 (95% ДИ 31,1-68,4). B группе пациентов, принимавших АБП (2A), среднее количество генов множественной лекарственной устойчивости (эффлюксные системы) оказалось значимо выше, чем у лиц контроля (группа 2B): 47,0 (95% ДИ 46,0-51,2) против 21,5 (95% ДИ 7,0^3,9). У пациентов с тяжелым течением коронавирусной инфекции отмечалась тенденция к выявлению более высокой медианы количества генов АБР, однако без статистической достоверности. Пациенты из группы с тяжелым течением COVID-19, не принимавшие АБП до момента госпитализации и не имеющие среди назначений АБП, тоже обладали большим числом генов резистентности, чем пациенты противоположной группы. Заключение. Настояшее исследование демонстрирует, что в группе с более легкой динамикой течения заболевания выявлено меньшее количество генов АБР, чем в группе с более тяжелым течением заболевания, где отмечалось увеличение генов АБР, среди которых доминировали отдельные 5 генов (SULI, MSRC, ACRE, EFMA, SAT}.

Авторы:

Издание: Терапевтический архив
Год издания: 2023
Объем: 9с.
Дополнительная информация: 2023.-N 12(2).-С.1103-1111. Библ. 9 назв.
Просмотров: 9